Protein–RNA interactions for Protein: Q91YR7

Prpf6, Pre-mRNA-processing factor 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 941 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf6Q91YR7 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prpf6Q91YR7 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prpf6Q91YR7 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prpf6Q91YR7 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prpf6Q91YR7 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prpf6Q91YR7 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prpf6Q91YR7 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prpf6Q91YR7 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Prpf6Q91YR7 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Prpf6Q91YR7 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Prpf6Q91YR7 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prpf6Q91YR7 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Prpf6Q91YR7 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Prpf6Q91YR7 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prpf6Q91YR7 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prpf6Q91YR7 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prpf6Q91YR7 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prpf6Q91YR7 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prpf6Q91YR7 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prpf6Q91YR7 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prpf6Q91YR7 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prpf6Q91YR7 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prpf6Q91YR7 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prpf6Q91YR7 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prpf6Q91YR7 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prpf6Q91YR7 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prpf6Q91YR7 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prpf6Q91YR7 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prpf6Q91YR7 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prpf6Q91YR7 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prpf6Q91YR7 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prpf6Q91YR7 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prpf6Q91YR7 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prpf6Q91YR7 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prpf6Q91YR7 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prpf6Q91YR7 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prpf6Q91YR7 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prpf6Q91YR7 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prpf6Q91YR7 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prpf6Q91YR7 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prpf6Q91YR7 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prpf6Q91YR7 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prpf6Q91YR7 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prpf6Q91YR7 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prpf6Q91YR7 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prpf6Q91YR7 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prpf6Q91YR7 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prpf6Q91YR7 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prpf6Q91YR7 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prpf6Q91YR7 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prpf6Q91YR7 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prpf6Q91YR7 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prpf6Q91YR7 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prpf6Q91YR7 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prpf6Q91YR7 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prpf6Q91YR7 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prpf6Q91YR7 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prpf6Q91YR7 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prpf6Q91YR7 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prpf6Q91YR7 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prpf6Q91YR7 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prpf6Q91YR7 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prpf6Q91YR7 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Prpf6Q91YR7 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Prpf6Q91YR7 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Prpf6Q91YR7 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Prpf6Q91YR7 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Prpf6Q91YR7 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prpf6Q91YR7 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prpf6Q91YR7 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prpf6Q91YR7 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prpf6Q91YR7 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prpf6Q91YR7 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prpf6Q91YR7 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Prpf6Q91YR7 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prpf6Q91YR7 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prpf6Q91YR7 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Prpf6Q91YR7 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prpf6Q91YR7 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prpf6Q91YR7 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prpf6Q91YR7 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prpf6Q91YR7 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prpf6Q91YR7 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prpf6Q91YR7 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prpf6Q91YR7 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prpf6Q91YR7 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prpf6Q91YR7 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prpf6Q91YR7 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prpf6Q91YR7 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prpf6Q91YR7 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prpf6Q91YR7 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prpf6Q91YR7 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prpf6Q91YR7 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prpf6Q91YR7 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prpf6Q91YR7 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prpf6Q91YR7 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prpf6Q91YR7 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prpf6Q91YR7 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prpf6Q91YR7 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prpf6Q91YR7 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.5 ms