Protein–RNA interactions for Protein: Q91YH5

Atl3, Atlastin-3, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atl3Q91YH5 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atl3Q91YH5 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Atl3Q91YH5 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atl3Q91YH5 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atl3Q91YH5 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atl3Q91YH5 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atl3Q91YH5 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atl3Q91YH5 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atl3Q91YH5 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atl3Q91YH5 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atl3Q91YH5 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atl3Q91YH5 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atl3Q91YH5 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atl3Q91YH5 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atl3Q91YH5 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atl3Q91YH5 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atl3Q91YH5 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atl3Q91YH5 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atl3Q91YH5 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atl3Q91YH5 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atl3Q91YH5 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atl3Q91YH5 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Atl3Q91YH5 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atl3Q91YH5 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atl3Q91YH5 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atl3Q91YH5 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atl3Q91YH5 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Atl3Q91YH5 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Atl3Q91YH5 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Atl3Q91YH5 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Atl3Q91YH5 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Atl3Q91YH5 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Atl3Q91YH5 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Atl3Q91YH5 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Atl3Q91YH5 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atl3Q91YH5 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atl3Q91YH5 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atl3Q91YH5 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atl3Q91YH5 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atl3Q91YH5 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atl3Q91YH5 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Atl3Q91YH5 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atl3Q91YH5 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Atl3Q91YH5 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atl3Q91YH5 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atl3Q91YH5 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atl3Q91YH5 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atl3Q91YH5 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atl3Q91YH5 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atl3Q91YH5 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atl3Q91YH5 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atl3Q91YH5 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atl3Q91YH5 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atl3Q91YH5 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atl3Q91YH5 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atl3Q91YH5 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atl3Q91YH5 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atl3Q91YH5 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atl3Q91YH5 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atl3Q91YH5 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Atl3Q91YH5 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atl3Q91YH5 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atl3Q91YH5 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atl3Q91YH5 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atl3Q91YH5 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atl3Q91YH5 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atl3Q91YH5 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atl3Q91YH5 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atl3Q91YH5 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atl3Q91YH5 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atl3Q91YH5 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atl3Q91YH5 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atl3Q91YH5 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atl3Q91YH5 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atl3Q91YH5 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atl3Q91YH5 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atl3Q91YH5 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atl3Q91YH5 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atl3Q91YH5 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atl3Q91YH5 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atl3Q91YH5 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atl3Q91YH5 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atl3Q91YH5 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atl3Q91YH5 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atl3Q91YH5 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atl3Q91YH5 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atl3Q91YH5 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atl3Q91YH5 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atl3Q91YH5 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atl3Q91YH5 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atl3Q91YH5 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atl3Q91YH5 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Atl3Q91YH5 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atl3Q91YH5 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atl3Q91YH5 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atl3Q91YH5 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atl3Q91YH5 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atl3Q91YH5 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atl3Q91YH5 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atl3Q91YH5 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms