Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCK7

Sycn, Syncollin, mousemouse

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SycnQ8VCK7 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
SycnQ8VCK7 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
SycnQ8VCK7 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
SycnQ8VCK7 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
SycnQ8VCK7 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
SycnQ8VCK7 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
SycnQ8VCK7 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
SycnQ8VCK7 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
SycnQ8VCK7 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
SycnQ8VCK7 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
SycnQ8VCK7 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
SycnQ8VCK7 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
SycnQ8VCK7 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
SycnQ8VCK7 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
SycnQ8VCK7 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
SycnQ8VCK7 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
SycnQ8VCK7 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
SycnQ8VCK7 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
SycnQ8VCK7 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
SycnQ8VCK7 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
SycnQ8VCK7 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
SycnQ8VCK7 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
SycnQ8VCK7 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
SycnQ8VCK7 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
SycnQ8VCK7 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
SycnQ8VCK7 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
SycnQ8VCK7 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
SycnQ8VCK7 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
SycnQ8VCK7 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
SycnQ8VCK7 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
SycnQ8VCK7 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
SycnQ8VCK7 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
SycnQ8VCK7 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
SycnQ8VCK7 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
SycnQ8VCK7 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
SycnQ8VCK7 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
SycnQ8VCK7 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
SycnQ8VCK7 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
SycnQ8VCK7 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
SycnQ8VCK7 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
SycnQ8VCK7 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
SycnQ8VCK7 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
SycnQ8VCK7 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
SycnQ8VCK7 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
SycnQ8VCK7 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
SycnQ8VCK7 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
SycnQ8VCK7 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SycnQ8VCK7 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
SycnQ8VCK7 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SycnQ8VCK7 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SycnQ8VCK7 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SycnQ8VCK7 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SycnQ8VCK7 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
SycnQ8VCK7 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
SycnQ8VCK7 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
SycnQ8VCK7 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SycnQ8VCK7 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SycnQ8VCK7 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SycnQ8VCK7 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SycnQ8VCK7 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SycnQ8VCK7 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SycnQ8VCK7 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SycnQ8VCK7 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SycnQ8VCK7 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SycnQ8VCK7 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SycnQ8VCK7 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SycnQ8VCK7 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
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SycnQ8VCK7 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
SycnQ8VCK7 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
SycnQ8VCK7 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
SycnQ8VCK7 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
SycnQ8VCK7 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SycnQ8VCK7 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SycnQ8VCK7 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
SycnQ8VCK7 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SycnQ8VCK7 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
SycnQ8VCK7 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SycnQ8VCK7 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SycnQ8VCK7 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SycnQ8VCK7 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SycnQ8VCK7 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SycnQ8VCK7 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SycnQ8VCK7 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SycnQ8VCK7 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SycnQ8VCK7 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
SycnQ8VCK7 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
SycnQ8VCK7 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SycnQ8VCK7 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SycnQ8VCK7 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
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