Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0D0

Cdk17, Cyclin-dependent kinase 17, mousemouse

Predictions only

Length 523 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk17Q8K0D0 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdk17Q8K0D0 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdk17Q8K0D0 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdk17Q8K0D0 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdk17Q8K0D0 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdk17Q8K0D0 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdk17Q8K0D0 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdk17Q8K0D0 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdk17Q8K0D0 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdk17Q8K0D0 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdk17Q8K0D0 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdk17Q8K0D0 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdk17Q8K0D0 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdk17Q8K0D0 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdk17Q8K0D0 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdk17Q8K0D0 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdk17Q8K0D0 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdk17Q8K0D0 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdk17Q8K0D0 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdk17Q8K0D0 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdk17Q8K0D0 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdk17Q8K0D0 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdk17Q8K0D0 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdk17Q8K0D0 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdk17Q8K0D0 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdk17Q8K0D0 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdk17Q8K0D0 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdk17Q8K0D0 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdk17Q8K0D0 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdk17Q8K0D0 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdk17Q8K0D0 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdk17Q8K0D0 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdk17Q8K0D0 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdk17Q8K0D0 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdk17Q8K0D0 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdk17Q8K0D0 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdk17Q8K0D0 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdk17Q8K0D0 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdk17Q8K0D0 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdk17Q8K0D0 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdk17Q8K0D0 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdk17Q8K0D0 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdk17Q8K0D0 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdk17Q8K0D0 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdk17Q8K0D0 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdk17Q8K0D0 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdk17Q8K0D0 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdk17Q8K0D0 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdk17Q8K0D0 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdk17Q8K0D0 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdk17Q8K0D0 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdk17Q8K0D0 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdk17Q8K0D0 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdk17Q8K0D0 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdk17Q8K0D0 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdk17Q8K0D0 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdk17Q8K0D0 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdk17Q8K0D0 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdk17Q8K0D0 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cdk17Q8K0D0 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cdk17Q8K0D0 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cdk17Q8K0D0 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cdk17Q8K0D0 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cdk17Q8K0D0 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdk17Q8K0D0 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdk17Q8K0D0 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdk17Q8K0D0 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdk17Q8K0D0 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdk17Q8K0D0 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdk17Q8K0D0 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdk17Q8K0D0 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdk17Q8K0D0 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdk17Q8K0D0 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdk17Q8K0D0 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdk17Q8K0D0 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdk17Q8K0D0 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdk17Q8K0D0 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdk17Q8K0D0 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdk17Q8K0D0 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdk17Q8K0D0 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdk17Q8K0D0 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdk17Q8K0D0 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdk17Q8K0D0 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdk17Q8K0D0 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdk17Q8K0D0 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdk17Q8K0D0 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdk17Q8K0D0 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdk17Q8K0D0 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdk17Q8K0D0 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdk17Q8K0D0 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdk17Q8K0D0 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdk17Q8K0D0 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdk17Q8K0D0 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdk17Q8K0D0 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdk17Q8K0D0 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdk17Q8K0D0 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdk17Q8K0D0 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdk17Q8K0D0 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdk17Q8K0D0 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdk17Q8K0D0 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.7 ms