Protein–RNA interactions for Protein: Q8CH25

Sltm, SAFB-like transcription modulator, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,031 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SltmQ8CH25 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SltmQ8CH25 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SltmQ8CH25 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SltmQ8CH25 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SltmQ8CH25 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SltmQ8CH25 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SltmQ8CH25 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SltmQ8CH25 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SltmQ8CH25 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SltmQ8CH25 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SltmQ8CH25 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SltmQ8CH25 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SltmQ8CH25 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SltmQ8CH25 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SltmQ8CH25 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SltmQ8CH25 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SltmQ8CH25 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SltmQ8CH25 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SltmQ8CH25 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SltmQ8CH25 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SltmQ8CH25 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SltmQ8CH25 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
SltmQ8CH25 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SltmQ8CH25 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SltmQ8CH25 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SltmQ8CH25 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SltmQ8CH25 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
SltmQ8CH25 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SltmQ8CH25 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SltmQ8CH25 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SltmQ8CH25 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SltmQ8CH25 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SltmQ8CH25 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
SltmQ8CH25 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SltmQ8CH25 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SltmQ8CH25 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SltmQ8CH25 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SltmQ8CH25 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SltmQ8CH25 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SltmQ8CH25 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SltmQ8CH25 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SltmQ8CH25 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SltmQ8CH25 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SltmQ8CH25 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SltmQ8CH25 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SltmQ8CH25 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SltmQ8CH25 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SltmQ8CH25 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SltmQ8CH25 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SltmQ8CH25 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SltmQ8CH25 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SltmQ8CH25 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SltmQ8CH25 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SltmQ8CH25 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SltmQ8CH25 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SltmQ8CH25 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SltmQ8CH25 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SltmQ8CH25 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SltmQ8CH25 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SltmQ8CH25 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SltmQ8CH25 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SltmQ8CH25 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SltmQ8CH25 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SltmQ8CH25 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
SltmQ8CH25 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
SltmQ8CH25 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SltmQ8CH25 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SltmQ8CH25 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SltmQ8CH25 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
SltmQ8CH25 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SltmQ8CH25 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SltmQ8CH25 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SltmQ8CH25 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SltmQ8CH25 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SltmQ8CH25 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
SltmQ8CH25 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SltmQ8CH25 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
SltmQ8CH25 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SltmQ8CH25 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SltmQ8CH25 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SltmQ8CH25 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SltmQ8CH25 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SltmQ8CH25 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SltmQ8CH25 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SltmQ8CH25 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SltmQ8CH25 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SltmQ8CH25 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
SltmQ8CH25 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SltmQ8CH25 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SltmQ8CH25 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SltmQ8CH25 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SltmQ8CH25 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SltmQ8CH25 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SltmQ8CH25 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SltmQ8CH25 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SltmQ8CH25 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SltmQ8CH25 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SltmQ8CH25 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SltmQ8CH25 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SltmQ8CH25 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms