Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD5

Ercc8, DNA excision repair protein ERCC-8, mousemouse

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc8Q8CFD5 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
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Ercc8Q8CFD5 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ercc8Q8CFD5 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Ercc8Q8CFD5 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Ercc8Q8CFD5 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
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Ercc8Q8CFD5 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ercc8Q8CFD5 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ercc8Q8CFD5 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ercc8Q8CFD5 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ercc8Q8CFD5 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
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Ercc8Q8CFD5 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
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Ercc8Q8CFD5 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
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Ercc8Q8CFD5 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
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Ercc8Q8CFD5 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
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Ercc8Q8CFD5 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
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Ercc8Q8CFD5 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
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Ercc8Q8CFD5 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ercc8Q8CFD5 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
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Ercc8Q8CFD5 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
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Ercc8Q8CFD5 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ercc8Q8CFD5 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
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Ercc8Q8CFD5 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ercc8Q8CFD5 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ercc8Q8CFD5 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ercc8Q8CFD5 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ercc8Q8CFD5 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ercc8Q8CFD5 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ercc8Q8CFD5 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ercc8Q8CFD5 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ercc8Q8CFD5 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ercc8Q8CFD5 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ercc8Q8CFD5 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ercc8Q8CFD5 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ercc8Q8CFD5 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ercc8Q8CFD5 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Ercc8Q8CFD5 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ercc8Q8CFD5 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Ercc8Q8CFD5 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ercc8Q8CFD5 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Ercc8Q8CFD5 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
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