Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD4

Snx8, Sorting nexin-8, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx8Q8CFD4 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snx8Q8CFD4 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snx8Q8CFD4 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snx8Q8CFD4 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snx8Q8CFD4 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snx8Q8CFD4 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snx8Q8CFD4 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snx8Q8CFD4 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snx8Q8CFD4 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snx8Q8CFD4 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snx8Q8CFD4 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snx8Q8CFD4 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snx8Q8CFD4 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snx8Q8CFD4 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snx8Q8CFD4 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snx8Q8CFD4 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snx8Q8CFD4 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snx8Q8CFD4 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snx8Q8CFD4 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snx8Q8CFD4 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snx8Q8CFD4 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snx8Q8CFD4 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snx8Q8CFD4 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snx8Q8CFD4 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snx8Q8CFD4 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snx8Q8CFD4 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snx8Q8CFD4 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snx8Q8CFD4 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snx8Q8CFD4 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snx8Q8CFD4 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snx8Q8CFD4 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snx8Q8CFD4 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snx8Q8CFD4 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snx8Q8CFD4 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snx8Q8CFD4 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snx8Q8CFD4 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Snx8Q8CFD4 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snx8Q8CFD4 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snx8Q8CFD4 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snx8Q8CFD4 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snx8Q8CFD4 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snx8Q8CFD4 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snx8Q8CFD4 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snx8Q8CFD4 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snx8Q8CFD4 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snx8Q8CFD4 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snx8Q8CFD4 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snx8Q8CFD4 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snx8Q8CFD4 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snx8Q8CFD4 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snx8Q8CFD4 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snx8Q8CFD4 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snx8Q8CFD4 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snx8Q8CFD4 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snx8Q8CFD4 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snx8Q8CFD4 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snx8Q8CFD4 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snx8Q8CFD4 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snx8Q8CFD4 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snx8Q8CFD4 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snx8Q8CFD4 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snx8Q8CFD4 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Snx8Q8CFD4 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snx8Q8CFD4 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snx8Q8CFD4 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snx8Q8CFD4 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snx8Q8CFD4 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snx8Q8CFD4 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snx8Q8CFD4 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snx8Q8CFD4 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snx8Q8CFD4 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snx8Q8CFD4 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snx8Q8CFD4 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snx8Q8CFD4 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snx8Q8CFD4 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snx8Q8CFD4 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snx8Q8CFD4 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snx8Q8CFD4 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snx8Q8CFD4 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snx8Q8CFD4 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snx8Q8CFD4 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snx8Q8CFD4 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snx8Q8CFD4 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Snx8Q8CFD4 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snx8Q8CFD4 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snx8Q8CFD4 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snx8Q8CFD4 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snx8Q8CFD4 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Snx8Q8CFD4 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Snx8Q8CFD4 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Snx8Q8CFD4 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snx8Q8CFD4 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snx8Q8CFD4 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snx8Q8CFD4 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snx8Q8CFD4 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snx8Q8CFD4 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snx8Q8CFD4 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snx8Q8CFD4 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snx8Q8CFD4 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snx8Q8CFD4 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms