Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEC0

Nup88, Nuclear pore complex protein Nup88, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup88Q8CEC0 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nup88Q8CEC0 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Nup88Q8CEC0 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Nup88Q8CEC0 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Nup88Q8CEC0 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Nup88Q8CEC0 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Nup88Q8CEC0 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nup88Q8CEC0 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nup88Q8CEC0 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nup88Q8CEC0 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nup88Q8CEC0 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nup88Q8CEC0 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nup88Q8CEC0 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Nup88Q8CEC0 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nup88Q8CEC0 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nup88Q8CEC0 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nup88Q8CEC0 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nup88Q8CEC0 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nup88Q8CEC0 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nup88Q8CEC0 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nup88Q8CEC0 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Nup88Q8CEC0 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nup88Q8CEC0 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nup88Q8CEC0 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Nup88Q8CEC0 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nup88Q8CEC0 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nup88Q8CEC0 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nup88Q8CEC0 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nup88Q8CEC0 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nup88Q8CEC0 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nup88Q8CEC0 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nup88Q8CEC0 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nup88Q8CEC0 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nup88Q8CEC0 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nup88Q8CEC0 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nup88Q8CEC0 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nup88Q8CEC0 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nup88Q8CEC0 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nup88Q8CEC0 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nup88Q8CEC0 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nup88Q8CEC0 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nup88Q8CEC0 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nup88Q8CEC0 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Nup88Q8CEC0 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nup88Q8CEC0 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nup88Q8CEC0 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Nup88Q8CEC0 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Nup88Q8CEC0 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nup88Q8CEC0 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Nup88Q8CEC0 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Nup88Q8CEC0 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nup88Q8CEC0 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nup88Q8CEC0 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nup88Q8CEC0 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nup88Q8CEC0 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nup88Q8CEC0 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nup88Q8CEC0 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nup88Q8CEC0 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nup88Q8CEC0 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nup88Q8CEC0 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nup88Q8CEC0 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nup88Q8CEC0 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nup88Q8CEC0 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nup88Q8CEC0 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nup88Q8CEC0 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nup88Q8CEC0 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nup88Q8CEC0 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Nup88Q8CEC0 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nup88Q8CEC0 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nup88Q8CEC0 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nup88Q8CEC0 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nup88Q8CEC0 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nup88Q8CEC0 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nup88Q8CEC0 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nup88Q8CEC0 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nup88Q8CEC0 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nup88Q8CEC0 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nup88Q8CEC0 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nup88Q8CEC0 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nup88Q8CEC0 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nup88Q8CEC0 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nup88Q8CEC0 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nup88Q8CEC0 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nup88Q8CEC0 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nup88Q8CEC0 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nup88Q8CEC0 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nup88Q8CEC0 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Nup88Q8CEC0 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nup88Q8CEC0 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nup88Q8CEC0 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nup88Q8CEC0 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nup88Q8CEC0 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nup88Q8CEC0 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nup88Q8CEC0 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nup88Q8CEC0 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nup88Q8CEC0 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nup88Q8CEC0 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nup88Q8CEC0 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nup88Q8CEC0 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nup88Q8CEC0 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.6 ms