Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBF3

Ephb1, Ephrin type-B receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 984 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ephb1Q8CBF3 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ephb1Q8CBF3 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ephb1Q8CBF3 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ephb1Q8CBF3 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ephb1Q8CBF3 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ephb1Q8CBF3 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Ephb1Q8CBF3 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Ephb1Q8CBF3 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Ephb1Q8CBF3 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ephb1Q8CBF3 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Ephb1Q8CBF3 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ephb1Q8CBF3 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ephb1Q8CBF3 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ephb1Q8CBF3 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ephb1Q8CBF3 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ephb1Q8CBF3 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ephb1Q8CBF3 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ephb1Q8CBF3 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ephb1Q8CBF3 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ephb1Q8CBF3 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ephb1Q8CBF3 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ephb1Q8CBF3 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ephb1Q8CBF3 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ephb1Q8CBF3 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ephb1Q8CBF3 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ephb1Q8CBF3 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ephb1Q8CBF3 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ephb1Q8CBF3 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Ephb1Q8CBF3 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ephb1Q8CBF3 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ephb1Q8CBF3 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Ephb1Q8CBF3 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ephb1Q8CBF3 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ephb1Q8CBF3 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ephb1Q8CBF3 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ephb1Q8CBF3 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ephb1Q8CBF3 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ephb1Q8CBF3 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ephb1Q8CBF3 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ephb1Q8CBF3 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ephb1Q8CBF3 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ephb1Q8CBF3 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ephb1Q8CBF3 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ephb1Q8CBF3 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ephb1Q8CBF3 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ephb1Q8CBF3 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ephb1Q8CBF3 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ephb1Q8CBF3 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ephb1Q8CBF3 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ephb1Q8CBF3 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ephb1Q8CBF3 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ephb1Q8CBF3 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ephb1Q8CBF3 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ephb1Q8CBF3 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ephb1Q8CBF3 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ephb1Q8CBF3 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Ephb1Q8CBF3 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Ephb1Q8CBF3 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ephb1Q8CBF3 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ephb1Q8CBF3 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ephb1Q8CBF3 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ephb1Q8CBF3 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ephb1Q8CBF3 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ephb1Q8CBF3 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ephb1Q8CBF3 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ephb1Q8CBF3 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ephb1Q8CBF3 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ephb1Q8CBF3 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ephb1Q8CBF3 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ephb1Q8CBF3 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ephb1Q8CBF3 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ephb1Q8CBF3 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ephb1Q8CBF3 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ephb1Q8CBF3 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ephb1Q8CBF3 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ephb1Q8CBF3 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Ephb1Q8CBF3 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ephb1Q8CBF3 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ephb1Q8CBF3 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ephb1Q8CBF3 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ephb1Q8CBF3 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ephb1Q8CBF3 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ephb1Q8CBF3 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ephb1Q8CBF3 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ephb1Q8CBF3 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ephb1Q8CBF3 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ephb1Q8CBF3 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ephb1Q8CBF3 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ephb1Q8CBF3 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ephb1Q8CBF3 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ephb1Q8CBF3 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ephb1Q8CBF3 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ephb1Q8CBF3 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ephb1Q8CBF3 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ephb1Q8CBF3 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ephb1Q8CBF3 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ephb1Q8CBF3 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ephb1Q8CBF3 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ephb1Q8CBF3 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ephb1Q8CBF3 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms