Protein–RNA interactions for Protein: Q8CB62

Cntrob, Centrobin, mousemouse

Predictions only

Length 887 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CntrobQ8CB62 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
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CntrobQ8CB62 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CntrobQ8CB62 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CntrobQ8CB62 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CntrobQ8CB62 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CntrobQ8CB62 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CntrobQ8CB62 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CntrobQ8CB62 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CntrobQ8CB62 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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CntrobQ8CB62 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CntrobQ8CB62 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CntrobQ8CB62 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CntrobQ8CB62 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CntrobQ8CB62 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CntrobQ8CB62 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CntrobQ8CB62 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CntrobQ8CB62 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CntrobQ8CB62 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
CntrobQ8CB62 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CntrobQ8CB62 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CntrobQ8CB62 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CntrobQ8CB62 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CntrobQ8CB62 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CntrobQ8CB62 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CntrobQ8CB62 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CntrobQ8CB62 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CntrobQ8CB62 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CntrobQ8CB62 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CntrobQ8CB62 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CntrobQ8CB62 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CntrobQ8CB62 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CntrobQ8CB62 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CntrobQ8CB62 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CntrobQ8CB62 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CntrobQ8CB62 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
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CntrobQ8CB62 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
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CntrobQ8CB62 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CntrobQ8CB62 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CntrobQ8CB62 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CntrobQ8CB62 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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CntrobQ8CB62 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CntrobQ8CB62 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CntrobQ8CB62 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CntrobQ8CB62 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CntrobQ8CB62 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CntrobQ8CB62 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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CntrobQ8CB62 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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CntrobQ8CB62 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CntrobQ8CB62 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CntrobQ8CB62 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CntrobQ8CB62 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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CntrobQ8CB62 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CntrobQ8CB62 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CntrobQ8CB62 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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CntrobQ8CB62 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CntrobQ8CB62 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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CntrobQ8CB62 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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CntrobQ8CB62 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CntrobQ8CB62 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CntrobQ8CB62 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CntrobQ8CB62 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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CntrobQ8CB62 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CntrobQ8CB62 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CntrobQ8CB62 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CntrobQ8CB62 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CntrobQ8CB62 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CntrobQ8CB62 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CntrobQ8CB62 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CntrobQ8CB62 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CntrobQ8CB62 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CntrobQ8CB62 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CntrobQ8CB62 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CntrobQ8CB62 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CntrobQ8CB62 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CntrobQ8CB62 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CntrobQ8CB62 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CntrobQ8CB62 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CntrobQ8CB62 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CntrobQ8CB62 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms