Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5T8

Ccdc113, Coiled-coil domain-containing protein 113, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc113Q8C5T8 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc113Q8C5T8 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc113Q8C5T8 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc113Q8C5T8 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc113Q8C5T8 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc113Q8C5T8 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc113Q8C5T8 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc113Q8C5T8 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc113Q8C5T8 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc113Q8C5T8 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc113Q8C5T8 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc113Q8C5T8 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc113Q8C5T8 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc113Q8C5T8 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc113Q8C5T8 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc113Q8C5T8 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc113Q8C5T8 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc113Q8C5T8 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc113Q8C5T8 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc113Q8C5T8 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc113Q8C5T8 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc113Q8C5T8 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc113Q8C5T8 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc113Q8C5T8 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc113Q8C5T8 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc113Q8C5T8 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc113Q8C5T8 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc113Q8C5T8 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc113Q8C5T8 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc113Q8C5T8 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc113Q8C5T8 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc113Q8C5T8 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc113Q8C5T8 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc113Q8C5T8 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc113Q8C5T8 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc113Q8C5T8 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc113Q8C5T8 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc113Q8C5T8 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc113Q8C5T8 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc113Q8C5T8 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc113Q8C5T8 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc113Q8C5T8 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc113Q8C5T8 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc113Q8C5T8 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc113Q8C5T8 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc113Q8C5T8 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc113Q8C5T8 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc113Q8C5T8 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc113Q8C5T8 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc113Q8C5T8 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc113Q8C5T8 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc113Q8C5T8 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc113Q8C5T8 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc113Q8C5T8 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc113Q8C5T8 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc113Q8C5T8 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc113Q8C5T8 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc113Q8C5T8 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc113Q8C5T8 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc113Q8C5T8 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc113Q8C5T8 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc113Q8C5T8 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc113Q8C5T8 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc113Q8C5T8 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc113Q8C5T8 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc113Q8C5T8 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc113Q8C5T8 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc113Q8C5T8 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc113Q8C5T8 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc113Q8C5T8 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc113Q8C5T8 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc113Q8C5T8 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc113Q8C5T8 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc113Q8C5T8 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc113Q8C5T8 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc113Q8C5T8 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc113Q8C5T8 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc113Q8C5T8 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc113Q8C5T8 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc113Q8C5T8 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc113Q8C5T8 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc113Q8C5T8 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc113Q8C5T8 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc113Q8C5T8 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc113Q8C5T8 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc113Q8C5T8 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc113Q8C5T8 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc113Q8C5T8 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc113Q8C5T8 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc113Q8C5T8 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc113Q8C5T8 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc113Q8C5T8 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc113Q8C5T8 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc113Q8C5T8 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc113Q8C5T8 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc113Q8C5T8 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc113Q8C5T8 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc113Q8C5T8 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc113Q8C5T8 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc113Q8C5T8 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 109 ms