Protein–RNA interactions for Protein: Q7TT28

Rexo1, RNA exonuclease 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rexo1Q7TT28 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rexo1Q7TT28 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rexo1Q7TT28 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rexo1Q7TT28 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rexo1Q7TT28 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rexo1Q7TT28 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rexo1Q7TT28 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rexo1Q7TT28 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rexo1Q7TT28 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rexo1Q7TT28 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rexo1Q7TT28 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rexo1Q7TT28 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Rexo1Q7TT28 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rexo1Q7TT28 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rexo1Q7TT28 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rexo1Q7TT28 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rexo1Q7TT28 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rexo1Q7TT28 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rexo1Q7TT28 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rexo1Q7TT28 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Rexo1Q7TT28 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Rexo1Q7TT28 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Rexo1Q7TT28 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rexo1Q7TT28 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rexo1Q7TT28 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rexo1Q7TT28 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rexo1Q7TT28 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rexo1Q7TT28 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rexo1Q7TT28 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rexo1Q7TT28 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rexo1Q7TT28 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rexo1Q7TT28 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rexo1Q7TT28 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rexo1Q7TT28 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rexo1Q7TT28 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rexo1Q7TT28 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rexo1Q7TT28 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Rexo1Q7TT28 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rexo1Q7TT28 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rexo1Q7TT28 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rexo1Q7TT28 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rexo1Q7TT28 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rexo1Q7TT28 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rexo1Q7TT28 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rexo1Q7TT28 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
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Rexo1Q7TT28 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rexo1Q7TT28 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
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Rexo1Q7TT28 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Rexo1Q7TT28 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rexo1Q7TT28 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Rexo1Q7TT28 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rexo1Q7TT28 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Rexo1Q7TT28 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
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Rexo1Q7TT28 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rexo1Q7TT28 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
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Rexo1Q7TT28 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rexo1Q7TT28 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rexo1Q7TT28 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
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Rexo1Q7TT28 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rexo1Q7TT28 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rexo1Q7TT28 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rexo1Q7TT28 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rexo1Q7TT28 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
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Rexo1Q7TT28 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rexo1Q7TT28 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Rexo1Q7TT28 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rexo1Q7TT28 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Rexo1Q7TT28 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Rexo1Q7TT28 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rexo1Q7TT28 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rexo1Q7TT28 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rexo1Q7TT28 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rexo1Q7TT28 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rexo1Q7TT28 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rexo1Q7TT28 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rexo1Q7TT28 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rexo1Q7TT28 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rexo1Q7TT28 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rexo1Q7TT28 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rexo1Q7TT28 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rexo1Q7TT28 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rexo1Q7TT28 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rexo1Q7TT28 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rexo1Q7TT28 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rexo1Q7TT28 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rexo1Q7TT28 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rexo1Q7TT28 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms