Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSG2

Ctdp1, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdp1Q7TSG2 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ctdp1Q7TSG2 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ctdp1Q7TSG2 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ctdp1Q7TSG2 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ctdp1Q7TSG2 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ctdp1Q7TSG2 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ctdp1Q7TSG2 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ctdp1Q7TSG2 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ctdp1Q7TSG2 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ctdp1Q7TSG2 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ctdp1Q7TSG2 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ctdp1Q7TSG2 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ctdp1Q7TSG2 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ctdp1Q7TSG2 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ctdp1Q7TSG2 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ctdp1Q7TSG2 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ctdp1Q7TSG2 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ctdp1Q7TSG2 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ctdp1Q7TSG2 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ctdp1Q7TSG2 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ctdp1Q7TSG2 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ctdp1Q7TSG2 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ctdp1Q7TSG2 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ctdp1Q7TSG2 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ctdp1Q7TSG2 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ctdp1Q7TSG2 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ctdp1Q7TSG2 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ctdp1Q7TSG2 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ctdp1Q7TSG2 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ctdp1Q7TSG2 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ctdp1Q7TSG2 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ctdp1Q7TSG2 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ctdp1Q7TSG2 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ctdp1Q7TSG2 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ctdp1Q7TSG2 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ctdp1Q7TSG2 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ctdp1Q7TSG2 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ctdp1Q7TSG2 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ctdp1Q7TSG2 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ctdp1Q7TSG2 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ctdp1Q7TSG2 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ctdp1Q7TSG2 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ctdp1Q7TSG2 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ctdp1Q7TSG2 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ctdp1Q7TSG2 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ctdp1Q7TSG2 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ctdp1Q7TSG2 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ctdp1Q7TSG2 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ctdp1Q7TSG2 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ctdp1Q7TSG2 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ctdp1Q7TSG2 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ctdp1Q7TSG2 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ctdp1Q7TSG2 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ctdp1Q7TSG2 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ctdp1Q7TSG2 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ctdp1Q7TSG2 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ctdp1Q7TSG2 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ctdp1Q7TSG2 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ctdp1Q7TSG2 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ctdp1Q7TSG2 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ctdp1Q7TSG2 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ctdp1Q7TSG2 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ctdp1Q7TSG2 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ctdp1Q7TSG2 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ctdp1Q7TSG2 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ctdp1Q7TSG2 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ctdp1Q7TSG2 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ctdp1Q7TSG2 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ctdp1Q7TSG2 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ctdp1Q7TSG2 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ctdp1Q7TSG2 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ctdp1Q7TSG2 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ctdp1Q7TSG2 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ctdp1Q7TSG2 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ctdp1Q7TSG2 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ctdp1Q7TSG2 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ctdp1Q7TSG2 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ctdp1Q7TSG2 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ctdp1Q7TSG2 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ctdp1Q7TSG2 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ctdp1Q7TSG2 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ctdp1Q7TSG2 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ctdp1Q7TSG2 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ctdp1Q7TSG2 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ctdp1Q7TSG2 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ctdp1Q7TSG2 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ctdp1Q7TSG2 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ctdp1Q7TSG2 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ctdp1Q7TSG2 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ctdp1Q7TSG2 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ctdp1Q7TSG2 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ctdp1Q7TSG2 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ctdp1Q7TSG2 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ctdp1Q7TSG2 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ctdp1Q7TSG2 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ctdp1Q7TSG2 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ctdp1Q7TSG2 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ctdp1Q7TSG2 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ctdp1Q7TSG2 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ctdp1Q7TSG2 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.6 ms