Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Dsg1bQ7TSF1 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Dsg1bQ7TSF1 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dsg1bQ7TSF1 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dsg1bQ7TSF1 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dsg1bQ7TSF1 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dsg1bQ7TSF1 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dsg1bQ7TSF1 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dsg1bQ7TSF1 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dsg1bQ7TSF1 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dsg1bQ7TSF1 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dsg1bQ7TSF1 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dsg1bQ7TSF1 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dsg1bQ7TSF1 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dsg1bQ7TSF1 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dsg1bQ7TSF1 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dsg1bQ7TSF1 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Dsg1bQ7TSF1 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Dsg1bQ7TSF1 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dsg1bQ7TSF1 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dsg1bQ7TSF1 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dsg1bQ7TSF1 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dsg1bQ7TSF1 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dsg1bQ7TSF1 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dsg1bQ7TSF1 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dsg1bQ7TSF1 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dsg1bQ7TSF1 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Dsg1bQ7TSF1 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dsg1bQ7TSF1 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dsg1bQ7TSF1 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dsg1bQ7TSF1 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dsg1bQ7TSF1 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dsg1bQ7TSF1 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dsg1bQ7TSF1 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dsg1bQ7TSF1 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dsg1bQ7TSF1 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Dsg1bQ7TSF1 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Dsg1bQ7TSF1 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Dsg1bQ7TSF1 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Dsg1bQ7TSF1 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Dsg1bQ7TSF1 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Dsg1bQ7TSF1 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Dsg1bQ7TSF1 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Dsg1bQ7TSF1 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Dsg1bQ7TSF1 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Dsg1bQ7TSF1 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Dsg1bQ7TSF1 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Dsg1bQ7TSF1 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Dsg1bQ7TSF1 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Dsg1bQ7TSF1 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Dsg1bQ7TSF1 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Dsg1bQ7TSF1 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Dsg1bQ7TSF1 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Dsg1bQ7TSF1 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Dsg1bQ7TSF1 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Dsg1bQ7TSF1 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Dsg1bQ7TSF1 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Dsg1bQ7TSF1 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Dsg1bQ7TSF1 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Dsg1bQ7TSF1 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Dsg1bQ7TSF1 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Dsg1bQ7TSF1 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Dsg1bQ7TSF1 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Dsg1bQ7TSF1 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Dsg1bQ7TSF1 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Dsg1bQ7TSF1 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Dsg1bQ7TSF1 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Dsg1bQ7TSF1 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Dsg1bQ7TSF1 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Dsg1bQ7TSF1 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Dsg1bQ7TSF1 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Dsg1bQ7TSF1 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Dsg1bQ7TSF1 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Dsg1bQ7TSF1 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Dsg1bQ7TSF1 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Dsg1bQ7TSF1 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Dsg1bQ7TSF1 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Dsg1bQ7TSF1 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Dsg1bQ7TSF1 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Dsg1bQ7TSF1 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Dsg1bQ7TSF1 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Dsg1bQ7TSF1 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Dsg1bQ7TSF1 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Dsg1bQ7TSF1 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Dsg1bQ7TSF1 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Dsg1bQ7TSF1 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Dsg1bQ7TSF1 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Dsg1bQ7TSF1 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Dsg1bQ7TSF1 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Dsg1bQ7TSF1 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Dsg1bQ7TSF1 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Dsg1bQ7TSF1 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Dsg1bQ7TSF1 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Dsg1bQ7TSF1 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Dsg1bQ7TSF1 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Dsg1bQ7TSF1 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Dsg1bQ7TSF1 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Dsg1bQ7TSF1 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Dsg1bQ7TSF1 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Dsg1bQ7TSF1 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms