Protein–RNA interactions for Protein: Q78Y63

Pdcl2, Phosducin-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcl2Q78Y63 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pdcl2Q78Y63 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pdcl2Q78Y63 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pdcl2Q78Y63 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pdcl2Q78Y63 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pdcl2Q78Y63 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pdcl2Q78Y63 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pdcl2Q78Y63 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pdcl2Q78Y63 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pdcl2Q78Y63 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pdcl2Q78Y63 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pdcl2Q78Y63 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pdcl2Q78Y63 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pdcl2Q78Y63 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pdcl2Q78Y63 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pdcl2Q78Y63 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pdcl2Q78Y63 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Pdcl2Q78Y63 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pdcl2Q78Y63 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pdcl2Q78Y63 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pdcl2Q78Y63 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pdcl2Q78Y63 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pdcl2Q78Y63 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pdcl2Q78Y63 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Pdcl2Q78Y63 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pdcl2Q78Y63 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pdcl2Q78Y63 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pdcl2Q78Y63 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pdcl2Q78Y63 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pdcl2Q78Y63 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pdcl2Q78Y63 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pdcl2Q78Y63 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pdcl2Q78Y63 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pdcl2Q78Y63 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pdcl2Q78Y63 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pdcl2Q78Y63 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pdcl2Q78Y63 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pdcl2Q78Y63 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pdcl2Q78Y63 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pdcl2Q78Y63 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pdcl2Q78Y63 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Pdcl2Q78Y63 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pdcl2Q78Y63 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Pdcl2Q78Y63 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pdcl2Q78Y63 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pdcl2Q78Y63 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pdcl2Q78Y63 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pdcl2Q78Y63 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pdcl2Q78Y63 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Pdcl2Q78Y63 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pdcl2Q78Y63 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pdcl2Q78Y63 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pdcl2Q78Y63 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pdcl2Q78Y63 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pdcl2Q78Y63 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pdcl2Q78Y63 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pdcl2Q78Y63 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Pdcl2Q78Y63 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pdcl2Q78Y63 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pdcl2Q78Y63 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pdcl2Q78Y63 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pdcl2Q78Y63 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pdcl2Q78Y63 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pdcl2Q78Y63 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pdcl2Q78Y63 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pdcl2Q78Y63 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pdcl2Q78Y63 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pdcl2Q78Y63 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pdcl2Q78Y63 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pdcl2Q78Y63 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pdcl2Q78Y63 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pdcl2Q78Y63 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pdcl2Q78Y63 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pdcl2Q78Y63 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pdcl2Q78Y63 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pdcl2Q78Y63 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pdcl2Q78Y63 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pdcl2Q78Y63 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pdcl2Q78Y63 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pdcl2Q78Y63 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pdcl2Q78Y63 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pdcl2Q78Y63 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pdcl2Q78Y63 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Pdcl2Q78Y63 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pdcl2Q78Y63 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pdcl2Q78Y63 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pdcl2Q78Y63 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pdcl2Q78Y63 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pdcl2Q78Y63 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pdcl2Q78Y63 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pdcl2Q78Y63 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pdcl2Q78Y63 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pdcl2Q78Y63 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pdcl2Q78Y63 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pdcl2Q78Y63 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pdcl2Q78Y63 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pdcl2Q78Y63 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pdcl2Q78Y63 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pdcl2Q78Y63 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pdcl2Q78Y63 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms