Protein–RNA interactions for Protein: Q6S5G4

Gja6, Gap junction alpha-6 protein, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja6Q6S5G4 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gja6Q6S5G4 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gja6Q6S5G4 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gja6Q6S5G4 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gja6Q6S5G4 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gja6Q6S5G4 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Gja6Q6S5G4 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gja6Q6S5G4 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gja6Q6S5G4 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gja6Q6S5G4 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gja6Q6S5G4 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gja6Q6S5G4 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gja6Q6S5G4 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gja6Q6S5G4 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gja6Q6S5G4 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gja6Q6S5G4 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gja6Q6S5G4 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gja6Q6S5G4 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Gja6Q6S5G4 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Gja6Q6S5G4 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Gja6Q6S5G4 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gja6Q6S5G4 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gja6Q6S5G4 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gja6Q6S5G4 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gja6Q6S5G4 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Gja6Q6S5G4 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Gja6Q6S5G4 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gja6Q6S5G4 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gja6Q6S5G4 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gja6Q6S5G4 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gja6Q6S5G4 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gja6Q6S5G4 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gja6Q6S5G4 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gja6Q6S5G4 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gja6Q6S5G4 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gja6Q6S5G4 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gja6Q6S5G4 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gja6Q6S5G4 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gja6Q6S5G4 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gja6Q6S5G4 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gja6Q6S5G4 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gja6Q6S5G4 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gja6Q6S5G4 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gja6Q6S5G4 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gja6Q6S5G4 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gja6Q6S5G4 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gja6Q6S5G4 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gja6Q6S5G4 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gja6Q6S5G4 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gja6Q6S5G4 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gja6Q6S5G4 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gja6Q6S5G4 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Gja6Q6S5G4 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gja6Q6S5G4 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gja6Q6S5G4 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Gja6Q6S5G4 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gja6Q6S5G4 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gja6Q6S5G4 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gja6Q6S5G4 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gja6Q6S5G4 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gja6Q6S5G4 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gja6Q6S5G4 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gja6Q6S5G4 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gja6Q6S5G4 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gja6Q6S5G4 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gja6Q6S5G4 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gja6Q6S5G4 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gja6Q6S5G4 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gja6Q6S5G4 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gja6Q6S5G4 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gja6Q6S5G4 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gja6Q6S5G4 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gja6Q6S5G4 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gja6Q6S5G4 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Gja6Q6S5G4 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gja6Q6S5G4 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gja6Q6S5G4 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gja6Q6S5G4 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gja6Q6S5G4 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gja6Q6S5G4 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gja6Q6S5G4 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Gja6Q6S5G4 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gja6Q6S5G4 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Gja6Q6S5G4 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Gja6Q6S5G4 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gja6Q6S5G4 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gja6Q6S5G4 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Gja6Q6S5G4 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gja6Q6S5G4 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gja6Q6S5G4 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gja6Q6S5G4 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gja6Q6S5G4 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gja6Q6S5G4 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gja6Q6S5G4 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gja6Q6S5G4 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gja6Q6S5G4 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gja6Q6S5G4 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gja6Q6S5G4 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gja6Q6S5G4 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gja6Q6S5G4 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.8 ms