Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2Q9

PRPF8, Pre-mRNA-processing-splicing factor 8, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 2,335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF8Q6P2Q9 ABCB9-211ENST00000540285 3330 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.774e-8■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 RAP1GDS1-211ENST00000508213 558 ntTSL 410.22□□□□□ -0.774e-8■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 MPP1-208ENST00000439370 2066 ntTSL 510.13□□□□□ -0.794e-8■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 CCNG1-201ENST00000340828 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.82e-9■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 SAP30L-AS1-201ENST00000501280 568 ntTSL 510.06□□□□□ -0.84e-8■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 CRTC2-205ENST00000467860 573 ntTSL 310.06□□□□□ -0.84e-8■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 DHX29-205ENST00000621106 4450 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.84e-8■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 ARL6IP5-204ENST00000484921 551 ntTSL 59.89□□□□□ -0.834e-8■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 SLIRP-206ENST00000556375 408 ntTSL 29.87□□□□□ -0.834e-15■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 SLIRP-205ENST00000556310 626 ntTSL 29.87□□□□□ -0.834e-15■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 ZZEF1-205ENST00000572699 689 ntTSL 39.82□□□□□ -0.844e-8■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 DEPDC1-201ENST00000370966 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.844e-8■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 PFAS-210ENST00000585183 581 ntTSL 39.65□□□□□ -0.874e-15■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 PFAS-206ENST00000581242 553 ntTSL 49.65□□□□□ -0.874e-15■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 TFEB-217ENST00000494822 524 ntTSL 39.63□□□□□ -0.874e-8■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 ZBTB8OS-212ENST00000479075 769 ntTSL 59.61□□□□□ -0.875e-11■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 GGCT-207ENST00000440082 1012 ntTSL 29.51□□□□□ -0.893e-22■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 SLIRP-212ENST00000613856 420 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.894e-15■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 EIF2B3-203ENST00000372183 1457 ntTSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.94e-8■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 ABCB9-206ENST00000442028 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.924e-8■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 GMDS-210ENST00000533279 817 ntTSL 59.3□□□□□ -0.924e-8■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 ABCB9-204ENST00000392439 3791 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.924e-8■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 AC084337.2-201ENST00000639224 589 ntAPPRIS ALT2 TSL 49.27□□□□□ -0.924e-8■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 GGCT-204ENST00000409390 767 ntTSL 2 BASIC9.2□□□□□ -0.943e-22■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 MICB-202ENST00000399150 2346 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.944e-8■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 EHMT2-207ENST00000463484 547 ntTSL 49.15□□□□□ -0.944e-8■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 SERAC1-202ENST00000367104 3948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.964e-8■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 ACSS2-217ENST00000488172 648 ntTSL 49.06□□□□□ -0.964e-8■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 ZBTB8OS-208ENST00000468695 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.965e-11■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 FNBP1-205ENST00000449089 2256 ntTSL 29.04□□□□□ -0.964e-15■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 MOV10-205ENST00000465579 610 ntTSL 29.01□□□□□ -0.974e-8■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 FNBP4-211ENST00000532646 919 ntTSL 28.97□□□□□ -0.974e-8■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 SAP30L-AS1-203ENST00000522312 569 ntTSL 4 BASIC8.95□□□□□ -0.984e-8■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 FNBP1-204ENST00000446176 5393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.984e-15■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 ARL6IP5-203ENST00000478935 1449 ntTSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.984e-8■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 DDX11-225ENST00000543511 571 ntTSL 58.86□□□□□ -0.994e-8■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 CDC25C-209ENST00000514555 1332 ntTSL 5 BASIC8.82□□□□□ -12e-8■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 DNHD1-202ENST00000354685 3205 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -14e-8■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 PSMD2-220ENST00000496925 723 ntTSL 28.75□□□□□ -1.012e-6■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 SPRY2-202ENST00000377104 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.014e-8■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 LCOR-207ENST00000469510 468 ntTSL 28.64□□□□□ -1.034e-8■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 ADAL-204ENST00000562188 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.56□□□□□ -1.044e-8■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 ARL6IP5-202ENST00000470936 580 ntTSL 28.52□□□□□ -1.054e-8■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 MTMR10-202ENST00000563714 2216 ntTSL 2 BASIC8.52□□□□□ -1.054e-8■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 DAD1-204ENST00000538631 441 ntTSL 2 BASIC8.46□□□□□ -1.054e-8■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 MOV10-208ENST00000475429 582 ntTSL 38.42□□□□□ -1.064e-8■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 QRSL1-201ENST00000369044 2158 ntTSL 2 BASIC8.38□□□□□ -1.074e-8■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 CCNG1-210ENST00000511683 1071 ntTSL 28.37□□□□□ -1.072e-9■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 HIBCH-203ENST00000392333 493 ntTSL 38.37□□□□□ -1.072e-7■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 MTMR10-207ENST00000567567 2833 ntTSL 28.35□□□□□ -1.074e-8■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 SFT2D1-203ENST00000479490 2061 ntTSL 1 (best)8.31□□□□□ -1.084e-8■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 DMTF1-233ENST00000582887 562 ntTSL 38.3□□□□□ -1.084e-8■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 ARL6IP5-205ENST00000485444 387 ntTSL 38.27□□□□□ -1.094e-8■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 TMEM231-201ENST00000258173 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.094e-8■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 GTF3C2-210ENST00000480989 604 ntTSL 48.24□□□□□ -1.094e-8■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 WIPF2-204ENST00000578304 439 ntTSL 58.24□□□□□ -1.094e-8■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 PDCD4-202ENST00000393104 3697 ntTSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.094e-8■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 ASAP1-205ENST00000519483 1449 ntTSL 58.11□□□□□ -1.114e-8■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 WDYHV1-207ENST00000523551 853 ntTSL 38.1□□□□□ -1.112e-7■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 ZNF761-205ENST00000613950 646 ntTSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.114e-8■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 ZNF544-212ENST00000598880 570 ntTSL 58.09□□□□□ -1.111e-7■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 ZNF544-215ENST00000599953 2274 ntTSL 5 BASIC8.03□□□□□ -1.121e-7■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 DAD1-203ENST00000535847 591 ntTSL 27.95□□□□□ -1.144e-8■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 ZNF544-204ENST00000595981 895 ntTSL 3 BASIC7.92□□□□□ -1.141e-7■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 PDCD2L-202ENST00000585821 594 ntTSL 27.87□□□□□ -1.154e-8■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 DHX29-201ENST00000251636 4502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.164e-8■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 TMEM231-203ENST00000562410 2991 ntTSL 1 (best)7.77□□□□□ -1.174e-8■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 LINC01426-202ENST00000420877 2632 ntTSL 2 BASIC7.74□□□□□ -1.174e-8■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 SAP30L-AS1-204ENST00000524264 1039 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.174e-8■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 SLC30A5-205ENST00000507354 2310 ntTSL 1 (best)7.7□□□□□ -1.184e-8■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 NUP54-207ENST00000508583 521 ntTSL 57.68□□□□□ -1.184e-8■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 MTMR10-201ENST00000435680 4961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.184e-8■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 GOLT1B-202ENST00000535593 813 ntTSL 1 (best)7.63□□□□□ -1.194e-8■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 MTMR10-209ENST00000568604 5679 ntTSL 1 (best)7.61□□□□□ -1.194e-8■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 DCAF5-203ENST00000553293 869 ntTSL 37.51□□□□□ -1.214e-8■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 MPP1-203ENST00000393529 794 ntTSL 57.47□□□□□ -1.214e-8■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 CDC25C-201ENST00000323760 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.222e-8■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 BAG1-201ENST00000379701 1977 ntTSL 27.42□□□□□ -1.224e-8■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 RAP1GDS1-218ENST00000512857 583 ntTSL 47.32□□□□□ -1.244e-8■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 SERAC1-205ENST00000607000 2284 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.254e-8■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 HEXB-211ENST00000513539 502 ntTSL 37.26□□□□□ -1.254e-8■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 HEXB-202ENST00000503312 756 ntTSL 57.26□□□□□ -1.254e-8■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 ADAL-208ENST00000610420 974 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.254e-8■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 BAG1-204ENST00000467389 1173 ntTSL 57.23□□□□□ -1.254e-8■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 SORL1-202ENST00000524633 1338 ntTSL 57.23□□□□□ -1.254e-8■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 ZBTB8OS-206ENST00000466361 538 ntTSL 27.23□□□□□ -1.255e-11■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 PDCD4-201ENST00000280154 3602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.264e-8■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 ASAP1-206ENST00000520189 572 ntTSL 47.17□□□□□ -1.264e-8■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 HEXB-210ENST00000513336 720 ntTSL 37.17□□□□□ -1.264e-8■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 CDC25C-203ENST00000415130 1556 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.272e-8■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 BAG1-205ENST00000468274 935 ntTSL 37.03□□□□□ -1.284e-8■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 MICB-204ENST00000538442 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.294e-8■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 BTBD10-203ENST00000525661 1125 ntTSL 26.99□□□□□ -1.294e-8■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 MEIS1-211ENST00000491706 1900 ntTSL 56.96□□□□□ -1.294e-8■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 SORL1-213ENST00000534754 2222 ntTSL 36.92□□□□□ -1.34e-8■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 CREBRF-205ENST00000522692 2466 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.34e-8■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 CAB39-207ENST00000614925 1619 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.317e-10■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 SERAC1-206ENST00000607071 4035 ntTSL 26.84□□□□□ -1.314e-8■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 GOLT1B-205ENST00000540141 1055 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC6.82□□□□□ -1.324e-8■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 CCDC77-211ENST00000540344 925 ntTSL 56.82□□□□□ -1.324e-8■■■■■ 30.4
Retrieved 100 of 73,762 protein–RNA pairs in 1170.4 ms