Protein–RNA interactions for Protein: Q62424

Hoxa13, Homeobox protein Hox-A13, mousemouse

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Length 386 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa13Q62424 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
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Hoxa13Q62424 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxa13Q62424 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxa13Q62424 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxa13Q62424 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
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Hoxa13Q62424 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxa13Q62424 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxa13Q62424 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxa13Q62424 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxa13Q62424 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxa13Q62424 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxa13Q62424 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxa13Q62424 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
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Hoxa13Q62424 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxa13Q62424 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxa13Q62424 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxa13Q62424 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
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Hoxa13Q62424 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
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Hoxa13Q62424 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
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Hoxa13Q62424 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxa13Q62424 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
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Hoxa13Q62424 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxa13Q62424 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxa13Q62424 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxa13Q62424 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxa13Q62424 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxa13Q62424 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
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Hoxa13Q62424 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
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Hoxa13Q62424 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxa13Q62424 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxa13Q62424 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
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Hoxa13Q62424 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxa13Q62424 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxa13Q62424 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxa13Q62424 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxa13Q62424 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxa13Q62424 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxa13Q62424 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxa13Q62424 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxa13Q62424 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxa13Q62424 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxa13Q62424 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxa13Q62424 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxa13Q62424 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxa13Q62424 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxa13Q62424 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxa13Q62424 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxa13Q62424 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxa13Q62424 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxa13Q62424 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxa13Q62424 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxa13Q62424 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxa13Q62424 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
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