Protein–RNA interactions for Protein: Q62401

Ccl12, C-C motif chemokine 12, mousemouse

Predictions only

Length 104 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl12Q62401 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccl12Q62401 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccl12Q62401 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccl12Q62401 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccl12Q62401 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccl12Q62401 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccl12Q62401 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccl12Q62401 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccl12Q62401 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccl12Q62401 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccl12Q62401 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccl12Q62401 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccl12Q62401 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccl12Q62401 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccl12Q62401 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccl12Q62401 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccl12Q62401 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccl12Q62401 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccl12Q62401 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccl12Q62401 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccl12Q62401 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccl12Q62401 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccl12Q62401 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccl12Q62401 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccl12Q62401 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccl12Q62401 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccl12Q62401 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccl12Q62401 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccl12Q62401 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccl12Q62401 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccl12Q62401 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccl12Q62401 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccl12Q62401 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccl12Q62401 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccl12Q62401 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccl12Q62401 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccl12Q62401 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccl12Q62401 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccl12Q62401 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccl12Q62401 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccl12Q62401 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccl12Q62401 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccl12Q62401 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccl12Q62401 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccl12Q62401 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccl12Q62401 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccl12Q62401 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccl12Q62401 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccl12Q62401 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccl12Q62401 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccl12Q62401 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccl12Q62401 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccl12Q62401 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccl12Q62401 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccl12Q62401 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccl12Q62401 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccl12Q62401 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccl12Q62401 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccl12Q62401 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccl12Q62401 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccl12Q62401 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccl12Q62401 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccl12Q62401 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccl12Q62401 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccl12Q62401 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccl12Q62401 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccl12Q62401 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccl12Q62401 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccl12Q62401 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccl12Q62401 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccl12Q62401 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccl12Q62401 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccl12Q62401 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccl12Q62401 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccl12Q62401 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccl12Q62401 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccl12Q62401 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccl12Q62401 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccl12Q62401 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccl12Q62401 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccl12Q62401 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccl12Q62401 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccl12Q62401 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccl12Q62401 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccl12Q62401 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccl12Q62401 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccl12Q62401 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccl12Q62401 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccl12Q62401 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccl12Q62401 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccl12Q62401 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccl12Q62401 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccl12Q62401 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccl12Q62401 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccl12Q62401 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccl12Q62401 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccl12Q62401 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccl12Q62401 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccl12Q62401 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccl12Q62401 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93 ms