Protein–RNA interactions for Protein: Q5SZ99

Trim38, Tripartite motif-containing 38, mousemouse

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim38Q5SZ99 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim38Q5SZ99 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim38Q5SZ99 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim38Q5SZ99 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim38Q5SZ99 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim38Q5SZ99 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim38Q5SZ99 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim38Q5SZ99 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim38Q5SZ99 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim38Q5SZ99 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim38Q5SZ99 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim38Q5SZ99 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim38Q5SZ99 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim38Q5SZ99 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim38Q5SZ99 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim38Q5SZ99 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim38Q5SZ99 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim38Q5SZ99 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim38Q5SZ99 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim38Q5SZ99 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim38Q5SZ99 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim38Q5SZ99 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim38Q5SZ99 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim38Q5SZ99 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim38Q5SZ99 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim38Q5SZ99 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim38Q5SZ99 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim38Q5SZ99 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim38Q5SZ99 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim38Q5SZ99 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim38Q5SZ99 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim38Q5SZ99 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim38Q5SZ99 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim38Q5SZ99 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim38Q5SZ99 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim38Q5SZ99 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim38Q5SZ99 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim38Q5SZ99 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim38Q5SZ99 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim38Q5SZ99 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim38Q5SZ99 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim38Q5SZ99 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim38Q5SZ99 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim38Q5SZ99 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim38Q5SZ99 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim38Q5SZ99 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim38Q5SZ99 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim38Q5SZ99 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim38Q5SZ99 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim38Q5SZ99 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim38Q5SZ99 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim38Q5SZ99 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim38Q5SZ99 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trim38Q5SZ99 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trim38Q5SZ99 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trim38Q5SZ99 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trim38Q5SZ99 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trim38Q5SZ99 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trim38Q5SZ99 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trim38Q5SZ99 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trim38Q5SZ99 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trim38Q5SZ99 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trim38Q5SZ99 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trim38Q5SZ99 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trim38Q5SZ99 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trim38Q5SZ99 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Trim38Q5SZ99 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trim38Q5SZ99 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Trim38Q5SZ99 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Trim38Q5SZ99 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Trim38Q5SZ99 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trim38Q5SZ99 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trim38Q5SZ99 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trim38Q5SZ99 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trim38Q5SZ99 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trim38Q5SZ99 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trim38Q5SZ99 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trim38Q5SZ99 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trim38Q5SZ99 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trim38Q5SZ99 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trim38Q5SZ99 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trim38Q5SZ99 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trim38Q5SZ99 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trim38Q5SZ99 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trim38Q5SZ99 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trim38Q5SZ99 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trim38Q5SZ99 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trim38Q5SZ99 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trim38Q5SZ99 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trim38Q5SZ99 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trim38Q5SZ99 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trim38Q5SZ99 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trim38Q5SZ99 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim38Q5SZ99 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim38Q5SZ99 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim38Q5SZ99 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim38Q5SZ99 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim38Q5SZ99 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim38Q5SZ99 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim38Q5SZ99 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms