Protein–RNA interactions for Protein: Q5FW85

Ecm2, Extracellular matrix protein 2, mousemouse

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Length 670 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ecm2Q5FW85 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Ecm2Q5FW85 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Ecm2Q5FW85 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Ecm2Q5FW85 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ecm2Q5FW85 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ecm2Q5FW85 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ecm2Q5FW85 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ecm2Q5FW85 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ecm2Q5FW85 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ecm2Q5FW85 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
Ecm2Q5FW85 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ecm2Q5FW85 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ecm2Q5FW85 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ecm2Q5FW85 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ecm2Q5FW85 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ecm2Q5FW85 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ecm2Q5FW85 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ecm2Q5FW85 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ecm2Q5FW85 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ecm2Q5FW85 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Ecm2Q5FW85 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ecm2Q5FW85 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ecm2Q5FW85 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ecm2Q5FW85 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ecm2Q5FW85 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ecm2Q5FW85 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ecm2Q5FW85 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ecm2Q5FW85 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ecm2Q5FW85 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ecm2Q5FW85 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ecm2Q5FW85 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Ecm2Q5FW85 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ecm2Q5FW85 Gm12962-202ENSMUST00000144212 691 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ecm2Q5FW85 Gm22119-201ENSMUST00000175594 99 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Ecm2Q5FW85 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ecm2Q5FW85 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ecm2Q5FW85 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ecm2Q5FW85 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ecm2Q5FW85 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ecm2Q5FW85 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ecm2Q5FW85 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ecm2Q5FW85 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ecm2Q5FW85 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ecm2Q5FW85 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ecm2Q5FW85 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ecm2Q5FW85 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ecm2Q5FW85 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ecm2Q5FW85 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ecm2Q5FW85 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ecm2Q5FW85 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ecm2Q5FW85 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ecm2Q5FW85 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ecm2Q5FW85 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ecm2Q5FW85 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ecm2Q5FW85 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ecm2Q5FW85 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ecm2Q5FW85 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ecm2Q5FW85 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ecm2Q5FW85 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ecm2Q5FW85 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ecm2Q5FW85 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ecm2Q5FW85 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ecm2Q5FW85 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ecm2Q5FW85 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ecm2Q5FW85 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ecm2Q5FW85 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ecm2Q5FW85 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ecm2Q5FW85 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ecm2Q5FW85 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ecm2Q5FW85 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ecm2Q5FW85 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ecm2Q5FW85 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ecm2Q5FW85 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ecm2Q5FW85 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ecm2Q5FW85 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ecm2Q5FW85 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ecm2Q5FW85 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ecm2Q5FW85 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ecm2Q5FW85 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ecm2Q5FW85 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ecm2Q5FW85 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ecm2Q5FW85 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ecm2Q5FW85 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ecm2Q5FW85 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Ecm2Q5FW85 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Ecm2Q5FW85 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Ecm2Q5FW85 Gm42997-202ENSMUST00000200321 985 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Ecm2Q5FW85 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ecm2Q5FW85 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ecm2Q5FW85 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ecm2Q5FW85 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ecm2Q5FW85 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ecm2Q5FW85 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ecm2Q5FW85 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ecm2Q5FW85 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ecm2Q5FW85 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ecm2Q5FW85 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ecm2Q5FW85 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ecm2Q5FW85 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ecm2Q5FW85 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.1 ms