Protein–RNA interactions for Protein: Q587J6

L1td1, LINE-1 type transposase domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
L1td1Q587J6 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
L1td1Q587J6 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
L1td1Q587J6 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
L1td1Q587J6 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
L1td1Q587J6 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
L1td1Q587J6 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
L1td1Q587J6 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
L1td1Q587J6 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
L1td1Q587J6 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
L1td1Q587J6 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
L1td1Q587J6 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
L1td1Q587J6 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
L1td1Q587J6 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
L1td1Q587J6 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
L1td1Q587J6 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
L1td1Q587J6 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
L1td1Q587J6 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
L1td1Q587J6 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
L1td1Q587J6 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
L1td1Q587J6 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
L1td1Q587J6 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
L1td1Q587J6 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
L1td1Q587J6 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
L1td1Q587J6 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
L1td1Q587J6 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
L1td1Q587J6 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
L1td1Q587J6 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
L1td1Q587J6 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
L1td1Q587J6 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
L1td1Q587J6 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
L1td1Q587J6 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
L1td1Q587J6 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
L1td1Q587J6 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
L1td1Q587J6 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
L1td1Q587J6 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
L1td1Q587J6 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
L1td1Q587J6 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
L1td1Q587J6 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
L1td1Q587J6 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
L1td1Q587J6 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
L1td1Q587J6 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
L1td1Q587J6 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
L1td1Q587J6 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
L1td1Q587J6 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
L1td1Q587J6 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
L1td1Q587J6 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
L1td1Q587J6 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
L1td1Q587J6 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
L1td1Q587J6 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
L1td1Q587J6 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
L1td1Q587J6 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
L1td1Q587J6 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
L1td1Q587J6 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
L1td1Q587J6 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
L1td1Q587J6 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
L1td1Q587J6 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
L1td1Q587J6 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
L1td1Q587J6 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
L1td1Q587J6 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
L1td1Q587J6 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
L1td1Q587J6 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
L1td1Q587J6 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
L1td1Q587J6 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
L1td1Q587J6 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
L1td1Q587J6 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
L1td1Q587J6 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
L1td1Q587J6 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
L1td1Q587J6 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
L1td1Q587J6 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
L1td1Q587J6 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
L1td1Q587J6 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
L1td1Q587J6 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
L1td1Q587J6 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
L1td1Q587J6 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
L1td1Q587J6 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
L1td1Q587J6 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
L1td1Q587J6 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
L1td1Q587J6 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
L1td1Q587J6 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
L1td1Q587J6 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
L1td1Q587J6 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
L1td1Q587J6 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
L1td1Q587J6 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
L1td1Q587J6 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
L1td1Q587J6 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
L1td1Q587J6 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
L1td1Q587J6 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
L1td1Q587J6 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
L1td1Q587J6 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
L1td1Q587J6 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
L1td1Q587J6 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
L1td1Q587J6 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
L1td1Q587J6 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
L1td1Q587J6 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
L1td1Q587J6 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
L1td1Q587J6 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
L1td1Q587J6 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
L1td1Q587J6 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
L1td1Q587J6 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
L1td1Q587J6 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms