Protein–RNA interactions for Protein: Q56A10

Znf608, Zinc finger protein 608, mousemouse

Predictions only

Length 1,511 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf608Q56A10 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
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Znf608Q56A10 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Znf608Q56A10 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
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Znf608Q56A10 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
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Znf608Q56A10 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Znf608Q56A10 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Znf608Q56A10 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Znf608Q56A10 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Znf608Q56A10 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
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Znf608Q56A10 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Znf608Q56A10 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Znf608Q56A10 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Znf608Q56A10 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Znf608Q56A10 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Znf608Q56A10 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
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Znf608Q56A10 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Znf608Q56A10 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Znf608Q56A10 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Znf608Q56A10 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Znf608Q56A10 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Znf608Q56A10 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Znf608Q56A10 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Znf608Q56A10 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
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Znf608Q56A10 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Znf608Q56A10 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Znf608Q56A10 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
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Znf608Q56A10 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Znf608Q56A10 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
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Znf608Q56A10 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Znf608Q56A10 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
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Znf608Q56A10 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Znf608Q56A10 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
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Znf608Q56A10 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
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Znf608Q56A10 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
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Znf608Q56A10 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Znf608Q56A10 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Znf608Q56A10 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Znf608Q56A10 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Znf608Q56A10 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Znf608Q56A10 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Znf608Q56A10 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Znf608Q56A10 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Znf608Q56A10 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Znf608Q56A10 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Znf608Q56A10 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Znf608Q56A10 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Znf608Q56A10 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Znf608Q56A10 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Znf608Q56A10 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Znf608Q56A10 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Znf608Q56A10 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Znf608Q56A10 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms