Protein–RNA interactions for Protein: Q3ZN08

Fam220a, Protein FAM220A, mousemouse

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Length 260 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam220aQ3ZN08 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Fam220aQ3ZN08 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Fam220aQ3ZN08 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Fam220aQ3ZN08 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Fam220aQ3ZN08 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Fam220aQ3ZN08 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Fam220aQ3ZN08 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Fam220aQ3ZN08 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Fam220aQ3ZN08 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Fam220aQ3ZN08 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Fam220aQ3ZN08 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Fam220aQ3ZN08 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Fam220aQ3ZN08 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Fam220aQ3ZN08 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Fam220aQ3ZN08 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Fam220aQ3ZN08 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Fam220aQ3ZN08 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Fam220aQ3ZN08 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Fam220aQ3ZN08 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Fam220aQ3ZN08 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Fam220aQ3ZN08 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Fam220aQ3ZN08 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Fam220aQ3ZN08 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Fam220aQ3ZN08 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Fam220aQ3ZN08 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Fam220aQ3ZN08 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Fam220aQ3ZN08 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Fam220aQ3ZN08 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Fam220aQ3ZN08 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Fam220aQ3ZN08 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Fam220aQ3ZN08 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Fam220aQ3ZN08 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Fam220aQ3ZN08 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Fam220aQ3ZN08 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Fam220aQ3ZN08 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Fam220aQ3ZN08 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Fam220aQ3ZN08 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Fam220aQ3ZN08 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Fam220aQ3ZN08 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Fam220aQ3ZN08 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Fam220aQ3ZN08 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Fam220aQ3ZN08 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Fam220aQ3ZN08 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Fam220aQ3ZN08 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Fam220aQ3ZN08 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Fam220aQ3ZN08 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Fam220aQ3ZN08 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Fam220aQ3ZN08 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Fam220aQ3ZN08 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Fam220aQ3ZN08 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Fam220aQ3ZN08 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Fam220aQ3ZN08 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Fam220aQ3ZN08 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Fam220aQ3ZN08 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Fam220aQ3ZN08 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Fam220aQ3ZN08 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Fam220aQ3ZN08 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Fam220aQ3ZN08 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Fam220aQ3ZN08 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Fam220aQ3ZN08 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Fam220aQ3ZN08 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Fam220aQ3ZN08 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Fam220aQ3ZN08 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Fam220aQ3ZN08 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Fam220aQ3ZN08 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Fam220aQ3ZN08 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Fam220aQ3ZN08 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Fam220aQ3ZN08 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Fam220aQ3ZN08 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
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Fam220aQ3ZN08 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
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Fam220aQ3ZN08 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Fam220aQ3ZN08 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Fam220aQ3ZN08 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Fam220aQ3ZN08 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Fam220aQ3ZN08 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Fam220aQ3ZN08 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Fam220aQ3ZN08 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Fam220aQ3ZN08 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Fam220aQ3ZN08 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Fam220aQ3ZN08 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Fam220aQ3ZN08 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Fam220aQ3ZN08 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Fam220aQ3ZN08 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Fam220aQ3ZN08 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Fam220aQ3ZN08 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Fam220aQ3ZN08 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Fam220aQ3ZN08 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Fam220aQ3ZN08 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Fam220aQ3ZN08 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Fam220aQ3ZN08 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Fam220aQ3ZN08 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Fam220aQ3ZN08 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Fam220aQ3ZN08 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Fam220aQ3ZN08 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Fam220aQ3ZN08 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Fam220aQ3ZN08 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Fam220aQ3ZN08 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
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