Protein–RNA interactions for Protein: Q3V125

Ccdc110, Coiled-coil domain-containing protein 110, mousemouse

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc110Q3V125 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc110Q3V125 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc110Q3V125 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc110Q3V125 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc110Q3V125 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc110Q3V125 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc110Q3V125 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc110Q3V125 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc110Q3V125 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc110Q3V125 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc110Q3V125 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc110Q3V125 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc110Q3V125 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc110Q3V125 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc110Q3V125 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc110Q3V125 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc110Q3V125 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc110Q3V125 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc110Q3V125 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc110Q3V125 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc110Q3V125 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc110Q3V125 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc110Q3V125 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc110Q3V125 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc110Q3V125 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc110Q3V125 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc110Q3V125 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc110Q3V125 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc110Q3V125 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc110Q3V125 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc110Q3V125 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc110Q3V125 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc110Q3V125 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc110Q3V125 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc110Q3V125 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc110Q3V125 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc110Q3V125 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc110Q3V125 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc110Q3V125 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc110Q3V125 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc110Q3V125 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc110Q3V125 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc110Q3V125 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc110Q3V125 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc110Q3V125 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc110Q3V125 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc110Q3V125 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc110Q3V125 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc110Q3V125 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc110Q3V125 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc110Q3V125 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc110Q3V125 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc110Q3V125 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc110Q3V125 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc110Q3V125 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc110Q3V125 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc110Q3V125 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc110Q3V125 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc110Q3V125 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc110Q3V125 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc110Q3V125 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc110Q3V125 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc110Q3V125 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc110Q3V125 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc110Q3V125 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc110Q3V125 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc110Q3V125 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc110Q3V125 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc110Q3V125 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc110Q3V125 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc110Q3V125 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc110Q3V125 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc110Q3V125 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc110Q3V125 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc110Q3V125 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc110Q3V125 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc110Q3V125 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc110Q3V125 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc110Q3V125 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc110Q3V125 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc110Q3V125 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc110Q3V125 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc110Q3V125 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc110Q3V125 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc110Q3V125 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc110Q3V125 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc110Q3V125 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc110Q3V125 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc110Q3V125 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc110Q3V125 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc110Q3V125 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc110Q3V125 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc110Q3V125 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc110Q3V125 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc110Q3V125 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc110Q3V125 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc110Q3V125 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc110Q3V125 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc110Q3V125 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc110Q3V125 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms