Protein–RNA interactions for Protein: Q3V038

Ttc9, Tetratricopeptide repeat protein 9A, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc9Q3V038 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ttc9Q3V038 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ttc9Q3V038 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ttc9Q3V038 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ttc9Q3V038 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ttc9Q3V038 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ttc9Q3V038 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ttc9Q3V038 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ttc9Q3V038 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ttc9Q3V038 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ttc9Q3V038 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ttc9Q3V038 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ttc9Q3V038 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ttc9Q3V038 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ttc9Q3V038 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ttc9Q3V038 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ttc9Q3V038 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ttc9Q3V038 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ttc9Q3V038 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ttc9Q3V038 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ttc9Q3V038 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ttc9Q3V038 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ttc9Q3V038 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ttc9Q3V038 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ttc9Q3V038 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ttc9Q3V038 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ttc9Q3V038 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ttc9Q3V038 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ttc9Q3V038 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ttc9Q3V038 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ttc9Q3V038 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ttc9Q3V038 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ttc9Q3V038 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ttc9Q3V038 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ttc9Q3V038 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ttc9Q3V038 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ttc9Q3V038 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ttc9Q3V038 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ttc9Q3V038 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ttc9Q3V038 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ttc9Q3V038 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ttc9Q3V038 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ttc9Q3V038 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ttc9Q3V038 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ttc9Q3V038 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ttc9Q3V038 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ttc9Q3V038 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ttc9Q3V038 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ttc9Q3V038 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ttc9Q3V038 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ttc9Q3V038 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ttc9Q3V038 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ttc9Q3V038 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ttc9Q3V038 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ttc9Q3V038 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ttc9Q3V038 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ttc9Q3V038 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ttc9Q3V038 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ttc9Q3V038 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ttc9Q3V038 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ttc9Q3V038 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ttc9Q3V038 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ttc9Q3V038 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ttc9Q3V038 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ttc9Q3V038 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ttc9Q3V038 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ttc9Q3V038 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ttc9Q3V038 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ttc9Q3V038 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ttc9Q3V038 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ttc9Q3V038 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ttc9Q3V038 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ttc9Q3V038 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ttc9Q3V038 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ttc9Q3V038 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ttc9Q3V038 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ttc9Q3V038 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ttc9Q3V038 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ttc9Q3V038 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ttc9Q3V038 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ttc9Q3V038 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ttc9Q3V038 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ttc9Q3V038 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ttc9Q3V038 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ttc9Q3V038 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ttc9Q3V038 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ttc9Q3V038 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ttc9Q3V038 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ttc9Q3V038 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ttc9Q3V038 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ttc9Q3V038 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ttc9Q3V038 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ttc9Q3V038 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ttc9Q3V038 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ttc9Q3V038 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ttc9Q3V038 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ttc9Q3V038 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ttc9Q3V038 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ttc9Q3V038 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ttc9Q3V038 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms