Protein–RNA interactions for Protein: Q3UU56

Gm29609, Predicted gene 29609, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm29609Q3UU56 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm29609Q3UU56 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm29609Q3UU56 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm29609Q3UU56 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm29609Q3UU56 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm29609Q3UU56 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm29609Q3UU56 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
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Gm29609Q3UU56 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm29609Q3UU56 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm29609Q3UU56 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm29609Q3UU56 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm29609Q3UU56 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm29609Q3UU56 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm29609Q3UU56 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm29609Q3UU56 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm29609Q3UU56 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm29609Q3UU56 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm29609Q3UU56 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm29609Q3UU56 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm29609Q3UU56 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm29609Q3UU56 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm29609Q3UU56 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm29609Q3UU56 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm29609Q3UU56 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm29609Q3UU56 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm29609Q3UU56 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
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Gm29609Q3UU56 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm29609Q3UU56 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm29609Q3UU56 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm29609Q3UU56 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm29609Q3UU56 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm29609Q3UU56 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm29609Q3UU56 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm29609Q3UU56 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm29609Q3UU56 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm29609Q3UU56 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm29609Q3UU56 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm29609Q3UU56 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm29609Q3UU56 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm29609Q3UU56 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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Gm29609Q3UU56 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm29609Q3UU56 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm29609Q3UU56 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm29609Q3UU56 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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Gm29609Q3UU56 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm29609Q3UU56 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm29609Q3UU56 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
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Gm29609Q3UU56 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm29609Q3UU56 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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Gm29609Q3UU56 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm29609Q3UU56 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm29609Q3UU56 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm29609Q3UU56 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm29609Q3UU56 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm29609Q3UU56 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm29609Q3UU56 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm29609Q3UU56 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm29609Q3UU56 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm29609Q3UU56 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm29609Q3UU56 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm29609Q3UU56 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm29609Q3UU56 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm29609Q3UU56 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm29609Q3UU56 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm29609Q3UU56 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm29609Q3UU56 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm29609Q3UU56 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
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