Protein–RNA interactions for Protein: Q3US59

Gm28047, Predicted gene, 28047, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28047Q3US59 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm28047Q3US59 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm28047Q3US59 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm28047Q3US59 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm28047Q3US59 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm28047Q3US59 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm28047Q3US59 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm28047Q3US59 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm28047Q3US59 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm28047Q3US59 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm28047Q3US59 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gm28047Q3US59 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gm28047Q3US59 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gm28047Q3US59 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gm28047Q3US59 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gm28047Q3US59 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gm28047Q3US59 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gm28047Q3US59 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gm28047Q3US59 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm28047Q3US59 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm28047Q3US59 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm28047Q3US59 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm28047Q3US59 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm28047Q3US59 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm28047Q3US59 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm28047Q3US59 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm28047Q3US59 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm28047Q3US59 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm28047Q3US59 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm28047Q3US59 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm28047Q3US59 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm28047Q3US59 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm28047Q3US59 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm28047Q3US59 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm28047Q3US59 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm28047Q3US59 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm28047Q3US59 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm28047Q3US59 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm28047Q3US59 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm28047Q3US59 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm28047Q3US59 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm28047Q3US59 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm28047Q3US59 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm28047Q3US59 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm28047Q3US59 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm28047Q3US59 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm28047Q3US59 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm28047Q3US59 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm28047Q3US59 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm28047Q3US59 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm28047Q3US59 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm28047Q3US59 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm28047Q3US59 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm28047Q3US59 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm28047Q3US59 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm28047Q3US59 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm28047Q3US59 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm28047Q3US59 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm28047Q3US59 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm28047Q3US59 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm28047Q3US59 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm28047Q3US59 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm28047Q3US59 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm28047Q3US59 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm28047Q3US59 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm28047Q3US59 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm28047Q3US59 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm28047Q3US59 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm28047Q3US59 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm28047Q3US59 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm28047Q3US59 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm28047Q3US59 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm28047Q3US59 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm28047Q3US59 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm28047Q3US59 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm28047Q3US59 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm28047Q3US59 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm28047Q3US59 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm28047Q3US59 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm28047Q3US59 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm28047Q3US59 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm28047Q3US59 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm28047Q3US59 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm28047Q3US59 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm28047Q3US59 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm28047Q3US59 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm28047Q3US59 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm28047Q3US59 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm28047Q3US59 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm28047Q3US59 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm28047Q3US59 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm28047Q3US59 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm28047Q3US59 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm28047Q3US59 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm28047Q3US59 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm28047Q3US59 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm28047Q3US59 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm28047Q3US59 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm28047Q3US59 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm28047Q3US59 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms