Protein–RNA interactions for Protein: Q3UNB8

Tmem253, Transmembrane protein 253, mousemouse

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Length 204 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem253Q3UNB8 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tmem253Q3UNB8 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tmem253Q3UNB8 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tmem253Q3UNB8 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tmem253Q3UNB8 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tmem253Q3UNB8 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tmem253Q3UNB8 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tmem253Q3UNB8 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tmem253Q3UNB8 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tmem253Q3UNB8 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tmem253Q3UNB8 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tmem253Q3UNB8 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tmem253Q3UNB8 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tmem253Q3UNB8 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Tmem253Q3UNB8 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tmem253Q3UNB8 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tmem253Q3UNB8 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tmem253Q3UNB8 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tmem253Q3UNB8 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tmem253Q3UNB8 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tmem253Q3UNB8 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tmem253Q3UNB8 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Tmem253Q3UNB8 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tmem253Q3UNB8 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tmem253Q3UNB8 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tmem253Q3UNB8 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tmem253Q3UNB8 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tmem253Q3UNB8 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tmem253Q3UNB8 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tmem253Q3UNB8 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tmem253Q3UNB8 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tmem253Q3UNB8 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tmem253Q3UNB8 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tmem253Q3UNB8 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tmem253Q3UNB8 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tmem253Q3UNB8 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Tmem253Q3UNB8 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tmem253Q3UNB8 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tmem253Q3UNB8 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tmem253Q3UNB8 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tmem253Q3UNB8 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tmem253Q3UNB8 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tmem253Q3UNB8 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tmem253Q3UNB8 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tmem253Q3UNB8 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tmem253Q3UNB8 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tmem253Q3UNB8 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tmem253Q3UNB8 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tmem253Q3UNB8 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tmem253Q3UNB8 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tmem253Q3UNB8 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tmem253Q3UNB8 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tmem253Q3UNB8 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tmem253Q3UNB8 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tmem253Q3UNB8 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tmem253Q3UNB8 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tmem253Q3UNB8 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tmem253Q3UNB8 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tmem253Q3UNB8 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tmem253Q3UNB8 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
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Tmem253Q3UNB8 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tmem253Q3UNB8 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tmem253Q3UNB8 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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Tmem253Q3UNB8 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tmem253Q3UNB8 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tmem253Q3UNB8 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tmem253Q3UNB8 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tmem253Q3UNB8 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Tmem253Q3UNB8 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tmem253Q3UNB8 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tmem253Q3UNB8 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tmem253Q3UNB8 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tmem253Q3UNB8 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tmem253Q3UNB8 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tmem253Q3UNB8 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Tmem253Q3UNB8 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tmem253Q3UNB8 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tmem253Q3UNB8 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tmem253Q3UNB8 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tmem253Q3UNB8 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tmem253Q3UNB8 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tmem253Q3UNB8 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tmem253Q3UNB8 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tmem253Q3UNB8 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tmem253Q3UNB8 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tmem253Q3UNB8 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tmem253Q3UNB8 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tmem253Q3UNB8 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tmem253Q3UNB8 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tmem253Q3UNB8 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tmem253Q3UNB8 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tmem253Q3UNB8 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tmem253Q3UNB8 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tmem253Q3UNB8 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tmem253Q3UNB8 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tmem253Q3UNB8 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tmem253Q3UNB8 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tmem253Q3UNB8 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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