Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMU9

Hdgfl2, Hepatoma-derived growth factor-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdgfl2Q3UMU9 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hdgfl2Q3UMU9 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hdgfl2Q3UMU9 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hdgfl2Q3UMU9 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hdgfl2Q3UMU9 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hdgfl2Q3UMU9 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hdgfl2Q3UMU9 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Hdgfl2Q3UMU9 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hdgfl2Q3UMU9 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Hdgfl2Q3UMU9 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hdgfl2Q3UMU9 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hdgfl2Q3UMU9 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Hdgfl2Q3UMU9 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hdgfl2Q3UMU9 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Hdgfl2Q3UMU9 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Hdgfl2Q3UMU9 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Hdgfl2Q3UMU9 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Hdgfl2Q3UMU9 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hdgfl2Q3UMU9 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Hdgfl2Q3UMU9 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hdgfl2Q3UMU9 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Hdgfl2Q3UMU9 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Hdgfl2Q3UMU9 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Hdgfl2Q3UMU9 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Hdgfl2Q3UMU9 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Hdgfl2Q3UMU9 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hdgfl2Q3UMU9 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hdgfl2Q3UMU9 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
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Hdgfl2Q3UMU9 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Hdgfl2Q3UMU9 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Hdgfl2Q3UMU9 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hdgfl2Q3UMU9 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hdgfl2Q3UMU9 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hdgfl2Q3UMU9 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Hdgfl2Q3UMU9 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hdgfl2Q3UMU9 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hdgfl2Q3UMU9 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hdgfl2Q3UMU9 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hdgfl2Q3UMU9 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hdgfl2Q3UMU9 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hdgfl2Q3UMU9 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hdgfl2Q3UMU9 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hdgfl2Q3UMU9 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hdgfl2Q3UMU9 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hdgfl2Q3UMU9 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Hdgfl2Q3UMU9 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Hdgfl2Q3UMU9 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Hdgfl2Q3UMU9 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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