Protein–RNA interactions for Protein: Q3UGY8

Arfgef3, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 2,170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfgef3Q3UGY8 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Arfgef3Q3UGY8 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Arfgef3Q3UGY8 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Arfgef3Q3UGY8 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Arfgef3Q3UGY8 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Arfgef3Q3UGY8 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Arfgef3Q3UGY8 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Arfgef3Q3UGY8 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Arfgef3Q3UGY8 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Arfgef3Q3UGY8 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Arfgef3Q3UGY8 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Arfgef3Q3UGY8 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Arfgef3Q3UGY8 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Arfgef3Q3UGY8 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Arfgef3Q3UGY8 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Arfgef3Q3UGY8 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Arfgef3Q3UGY8 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Arfgef3Q3UGY8 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Arfgef3Q3UGY8 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Arfgef3Q3UGY8 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Arfgef3Q3UGY8 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Arfgef3Q3UGY8 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Arfgef3Q3UGY8 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Arfgef3Q3UGY8 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Arfgef3Q3UGY8 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Arfgef3Q3UGY8 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Arfgef3Q3UGY8 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Arfgef3Q3UGY8 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Arfgef3Q3UGY8 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Arfgef3Q3UGY8 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Arfgef3Q3UGY8 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Arfgef3Q3UGY8 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Arfgef3Q3UGY8 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Arfgef3Q3UGY8 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Arfgef3Q3UGY8 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Arfgef3Q3UGY8 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Arfgef3Q3UGY8 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Arfgef3Q3UGY8 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Arfgef3Q3UGY8 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Arfgef3Q3UGY8 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Arfgef3Q3UGY8 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Arfgef3Q3UGY8 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Arfgef3Q3UGY8 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Arfgef3Q3UGY8 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Arfgef3Q3UGY8 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Arfgef3Q3UGY8 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Arfgef3Q3UGY8 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Arfgef3Q3UGY8 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Arfgef3Q3UGY8 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Arfgef3Q3UGY8 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Arfgef3Q3UGY8 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Arfgef3Q3UGY8 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Arfgef3Q3UGY8 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Arfgef3Q3UGY8 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Arfgef3Q3UGY8 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Arfgef3Q3UGY8 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Arfgef3Q3UGY8 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Arfgef3Q3UGY8 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Arfgef3Q3UGY8 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Arfgef3Q3UGY8 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Arfgef3Q3UGY8 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Arfgef3Q3UGY8 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Arfgef3Q3UGY8 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Arfgef3Q3UGY8 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Arfgef3Q3UGY8 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Arfgef3Q3UGY8 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Arfgef3Q3UGY8 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Arfgef3Q3UGY8 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Arfgef3Q3UGY8 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Arfgef3Q3UGY8 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Arfgef3Q3UGY8 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Arfgef3Q3UGY8 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Arfgef3Q3UGY8 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Arfgef3Q3UGY8 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Arfgef3Q3UGY8 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Arfgef3Q3UGY8 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Arfgef3Q3UGY8 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Arfgef3Q3UGY8 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Arfgef3Q3UGY8 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Arfgef3Q3UGY8 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Arfgef3Q3UGY8 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Arfgef3Q3UGY8 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Arfgef3Q3UGY8 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Arfgef3Q3UGY8 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Arfgef3Q3UGY8 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Arfgef3Q3UGY8 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Arfgef3Q3UGY8 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Arfgef3Q3UGY8 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Arfgef3Q3UGY8 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Arfgef3Q3UGY8 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Arfgef3Q3UGY8 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Arfgef3Q3UGY8 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Arfgef3Q3UGY8 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms