Protein–RNA interactions for Protein: Q3UBG2

Pid1, PTB-containing, cubilin and LRP1-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pid1Q3UBG2 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pid1Q3UBG2 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pid1Q3UBG2 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Pid1Q3UBG2 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pid1Q3UBG2 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pid1Q3UBG2 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pid1Q3UBG2 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pid1Q3UBG2 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pid1Q3UBG2 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pid1Q3UBG2 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pid1Q3UBG2 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pid1Q3UBG2 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pid1Q3UBG2 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pid1Q3UBG2 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pid1Q3UBG2 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pid1Q3UBG2 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pid1Q3UBG2 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pid1Q3UBG2 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pid1Q3UBG2 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pid1Q3UBG2 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Pid1Q3UBG2 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pid1Q3UBG2 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pid1Q3UBG2 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pid1Q3UBG2 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pid1Q3UBG2 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pid1Q3UBG2 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Pid1Q3UBG2 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pid1Q3UBG2 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pid1Q3UBG2 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Pid1Q3UBG2 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Pid1Q3UBG2 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Pid1Q3UBG2 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Pid1Q3UBG2 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Pid1Q3UBG2 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pid1Q3UBG2 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pid1Q3UBG2 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Pid1Q3UBG2 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Pid1Q3UBG2 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pid1Q3UBG2 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pid1Q3UBG2 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pid1Q3UBG2 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pid1Q3UBG2 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pid1Q3UBG2 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pid1Q3UBG2 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pid1Q3UBG2 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Pid1Q3UBG2 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pid1Q3UBG2 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pid1Q3UBG2 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pid1Q3UBG2 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pid1Q3UBG2 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Pid1Q3UBG2 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pid1Q3UBG2 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pid1Q3UBG2 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pid1Q3UBG2 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pid1Q3UBG2 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Pid1Q3UBG2 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pid1Q3UBG2 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pid1Q3UBG2 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pid1Q3UBG2 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pid1Q3UBG2 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pid1Q3UBG2 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pid1Q3UBG2 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Pid1Q3UBG2 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Pid1Q3UBG2 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pid1Q3UBG2 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Pid1Q3UBG2 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Pid1Q3UBG2 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Pid1Q3UBG2 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Pid1Q3UBG2 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Pid1Q3UBG2 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Pid1Q3UBG2 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pid1Q3UBG2 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pid1Q3UBG2 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pid1Q3UBG2 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Pid1Q3UBG2 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pid1Q3UBG2 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pid1Q3UBG2 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pid1Q3UBG2 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pid1Q3UBG2 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pid1Q3UBG2 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pid1Q3UBG2 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pid1Q3UBG2 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pid1Q3UBG2 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Pid1Q3UBG2 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pid1Q3UBG2 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pid1Q3UBG2 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pid1Q3UBG2 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pid1Q3UBG2 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pid1Q3UBG2 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pid1Q3UBG2 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pid1Q3UBG2 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pid1Q3UBG2 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pid1Q3UBG2 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pid1Q3UBG2 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pid1Q3UBG2 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pid1Q3UBG2 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pid1Q3UBG2 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pid1Q3UBG2 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC15.06■□□□□ 0
Pid1Q3UBG2 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pid1Q3UBG2 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms