Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3Q1

Ulk3, Serine/threonine-protein kinase ULK3, mousemouse

Predictions only

Length 472 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk3Q3U3Q1 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ulk3Q3U3Q1 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ulk3Q3U3Q1 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ulk3Q3U3Q1 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ulk3Q3U3Q1 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ulk3Q3U3Q1 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ulk3Q3U3Q1 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ulk3Q3U3Q1 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ulk3Q3U3Q1 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ulk3Q3U3Q1 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Ulk3Q3U3Q1 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ulk3Q3U3Q1 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ulk3Q3U3Q1 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Ulk3Q3U3Q1 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ulk3Q3U3Q1 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ulk3Q3U3Q1 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ulk3Q3U3Q1 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ulk3Q3U3Q1 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ulk3Q3U3Q1 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ulk3Q3U3Q1 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ulk3Q3U3Q1 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ulk3Q3U3Q1 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ulk3Q3U3Q1 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ulk3Q3U3Q1 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ulk3Q3U3Q1 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ulk3Q3U3Q1 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ulk3Q3U3Q1 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ulk3Q3U3Q1 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Ulk3Q3U3Q1 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ulk3Q3U3Q1 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ulk3Q3U3Q1 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ulk3Q3U3Q1 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ulk3Q3U3Q1 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ulk3Q3U3Q1 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ulk3Q3U3Q1 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ulk3Q3U3Q1 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ulk3Q3U3Q1 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ulk3Q3U3Q1 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ulk3Q3U3Q1 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ulk3Q3U3Q1 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ulk3Q3U3Q1 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ulk3Q3U3Q1 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ulk3Q3U3Q1 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ulk3Q3U3Q1 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ulk3Q3U3Q1 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ulk3Q3U3Q1 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ulk3Q3U3Q1 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Ulk3Q3U3Q1 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ulk3Q3U3Q1 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ulk3Q3U3Q1 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ulk3Q3U3Q1 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ulk3Q3U3Q1 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ulk3Q3U3Q1 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ulk3Q3U3Q1 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Ulk3Q3U3Q1 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Ulk3Q3U3Q1 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Ulk3Q3U3Q1 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ulk3Q3U3Q1 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ulk3Q3U3Q1 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ulk3Q3U3Q1 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ulk3Q3U3Q1 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ulk3Q3U3Q1 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ulk3Q3U3Q1 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ulk3Q3U3Q1 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ulk3Q3U3Q1 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ulk3Q3U3Q1 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ulk3Q3U3Q1 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ulk3Q3U3Q1 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ulk3Q3U3Q1 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ulk3Q3U3Q1 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ulk3Q3U3Q1 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ulk3Q3U3Q1 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ulk3Q3U3Q1 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ulk3Q3U3Q1 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ulk3Q3U3Q1 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Ulk3Q3U3Q1 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Ulk3Q3U3Q1 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ulk3Q3U3Q1 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ulk3Q3U3Q1 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ulk3Q3U3Q1 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ulk3Q3U3Q1 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Ulk3Q3U3Q1 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Ulk3Q3U3Q1 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC14.08□□□□□ -0.15
Ulk3Q3U3Q1 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Ulk3Q3U3Q1 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.15
Ulk3Q3U3Q1 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Ulk3Q3U3Q1 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.15
Ulk3Q3U3Q1 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ulk3Q3U3Q1 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ulk3Q3U3Q1 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ulk3Q3U3Q1 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Ulk3Q3U3Q1 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Ulk3Q3U3Q1 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ulk3Q3U3Q1 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ulk3Q3U3Q1 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ulk3Q3U3Q1 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ulk3Q3U3Q1 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ulk3Q3U3Q1 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Ulk3Q3U3Q1 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ulk3Q3U3Q1 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms