Protein–RNA interactions for Protein: Q3LRV9

Treml4, Trem-like transcript 4 protein, mousemouse

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Length 263 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Treml4Q3LRV9 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Treml4Q3LRV9 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Treml4Q3LRV9 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Treml4Q3LRV9 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Treml4Q3LRV9 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Treml4Q3LRV9 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Treml4Q3LRV9 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Treml4Q3LRV9 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Treml4Q3LRV9 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Treml4Q3LRV9 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Treml4Q3LRV9 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Treml4Q3LRV9 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Treml4Q3LRV9 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
Treml4Q3LRV9 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Treml4Q3LRV9 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
Treml4Q3LRV9 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Treml4Q3LRV9 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Treml4Q3LRV9 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Treml4Q3LRV9 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Treml4Q3LRV9 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Treml4Q3LRV9 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Treml4Q3LRV9 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Treml4Q3LRV9 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Treml4Q3LRV9 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Treml4Q3LRV9 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Treml4Q3LRV9 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Treml4Q3LRV9 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Treml4Q3LRV9 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Treml4Q3LRV9 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Treml4Q3LRV9 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Treml4Q3LRV9 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Treml4Q3LRV9 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Treml4Q3LRV9 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Treml4Q3LRV9 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Treml4Q3LRV9 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Treml4Q3LRV9 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Treml4Q3LRV9 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Treml4Q3LRV9 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Treml4Q3LRV9 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Treml4Q3LRV9 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Treml4Q3LRV9 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Treml4Q3LRV9 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Treml4Q3LRV9 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Treml4Q3LRV9 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Treml4Q3LRV9 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Treml4Q3LRV9 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Treml4Q3LRV9 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Treml4Q3LRV9 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Treml4Q3LRV9 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Treml4Q3LRV9 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Treml4Q3LRV9 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Treml4Q3LRV9 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Treml4Q3LRV9 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Treml4Q3LRV9 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Treml4Q3LRV9 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Treml4Q3LRV9 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Treml4Q3LRV9 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Treml4Q3LRV9 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Treml4Q3LRV9 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Treml4Q3LRV9 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Treml4Q3LRV9 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Treml4Q3LRV9 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Treml4Q3LRV9 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Treml4Q3LRV9 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Treml4Q3LRV9 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Treml4Q3LRV9 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Treml4Q3LRV9 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Treml4Q3LRV9 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Treml4Q3LRV9 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Treml4Q3LRV9 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Treml4Q3LRV9 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Treml4Q3LRV9 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Treml4Q3LRV9 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Treml4Q3LRV9 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Treml4Q3LRV9 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Treml4Q3LRV9 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Treml4Q3LRV9 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Treml4Q3LRV9 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Treml4Q3LRV9 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Treml4Q3LRV9 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Treml4Q3LRV9 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Treml4Q3LRV9 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Treml4Q3LRV9 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Treml4Q3LRV9 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Treml4Q3LRV9 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Treml4Q3LRV9 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Treml4Q3LRV9 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Treml4Q3LRV9 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Treml4Q3LRV9 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Treml4Q3LRV9 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Treml4Q3LRV9 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Treml4Q3LRV9 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Treml4Q3LRV9 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Treml4Q3LRV9 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Treml4Q3LRV9 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Treml4Q3LRV9 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Treml4Q3LRV9 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Treml4Q3LRV9 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Treml4Q3LRV9 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
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