Protein–RNA interactions for Protein: Q14699

RFTN1, Raftlin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 578 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN1Q14699 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RFTN1Q14699 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RFTN1Q14699 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RFTN1Q14699 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
RFTN1Q14699 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RFTN1Q14699 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RFTN1Q14699 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RFTN1Q14699 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
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RFTN1Q14699 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RFTN1Q14699 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RFTN1Q14699 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
RFTN1Q14699 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RFTN1Q14699 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RFTN1Q14699 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RFTN1Q14699 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RFTN1Q14699 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
RFTN1Q14699 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RFTN1Q14699 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RFTN1Q14699 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RFTN1Q14699 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RFTN1Q14699 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RFTN1Q14699 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
RFTN1Q14699 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RFTN1Q14699 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RFTN1Q14699 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RFTN1Q14699 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RFTN1Q14699 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RFTN1Q14699 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RFTN1Q14699 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RFTN1Q14699 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RFTN1Q14699 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RFTN1Q14699 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RFTN1Q14699 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RFTN1Q14699 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RFTN1Q14699 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RFTN1Q14699 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RFTN1Q14699 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RFTN1Q14699 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RFTN1Q14699 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
RFTN1Q14699 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
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RFTN1Q14699 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RFTN1Q14699 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RFTN1Q14699 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RFTN1Q14699 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RFTN1Q14699 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RFTN1Q14699 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RFTN1Q14699 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
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RFTN1Q14699 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
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RFTN1Q14699 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
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RFTN1Q14699 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RFTN1Q14699 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RFTN1Q14699 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RFTN1Q14699 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
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RFTN1Q14699 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
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RFTN1Q14699 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RFTN1Q14699 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RFTN1Q14699 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RFTN1Q14699 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RFTN1Q14699 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RFTN1Q14699 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RFTN1Q14699 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RFTN1Q14699 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
RFTN1Q14699 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RFTN1Q14699 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
RFTN1Q14699 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RFTN1Q14699 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RFTN1Q14699 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RFTN1Q14699 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RFTN1Q14699 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RFTN1Q14699 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RFTN1Q14699 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RFTN1Q14699 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
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