Protein–RNA interactions for Protein: Q08460

Kcnma1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnma1Q08460 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kcnma1Q08460 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kcnma1Q08460 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Kcnma1Q08460 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kcnma1Q08460 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Kcnma1Q08460 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Kcnma1Q08460 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kcnma1Q08460 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kcnma1Q08460 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kcnma1Q08460 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kcnma1Q08460 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kcnma1Q08460 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kcnma1Q08460 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kcnma1Q08460 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kcnma1Q08460 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kcnma1Q08460 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kcnma1Q08460 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kcnma1Q08460 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kcnma1Q08460 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Kcnma1Q08460 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Kcnma1Q08460 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Kcnma1Q08460 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Kcnma1Q08460 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Kcnma1Q08460 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Kcnma1Q08460 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Kcnma1Q08460 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Kcnma1Q08460 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Kcnma1Q08460 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Kcnma1Q08460 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Kcnma1Q08460 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Kcnma1Q08460 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Kcnma1Q08460 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Kcnma1Q08460 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Kcnma1Q08460 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Kcnma1Q08460 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Kcnma1Q08460 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Kcnma1Q08460 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Kcnma1Q08460 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Kcnma1Q08460 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Kcnma1Q08460 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Kcnma1Q08460 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Kcnma1Q08460 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Kcnma1Q08460 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Kcnma1Q08460 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Kcnma1Q08460 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Kcnma1Q08460 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Kcnma1Q08460 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Kcnma1Q08460 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Kcnma1Q08460 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Kcnma1Q08460 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Kcnma1Q08460 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Kcnma1Q08460 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Kcnma1Q08460 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Kcnma1Q08460 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Kcnma1Q08460 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Kcnma1Q08460 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Kcnma1Q08460 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Kcnma1Q08460 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Kcnma1Q08460 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Kcnma1Q08460 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Kcnma1Q08460 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Kcnma1Q08460 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Kcnma1Q08460 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Kcnma1Q08460 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Kcnma1Q08460 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Kcnma1Q08460 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Kcnma1Q08460 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Kcnma1Q08460 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Kcnma1Q08460 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Kcnma1Q08460 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Kcnma1Q08460 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Kcnma1Q08460 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Kcnma1Q08460 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Kcnma1Q08460 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Kcnma1Q08460 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Kcnma1Q08460 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Kcnma1Q08460 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Kcnma1Q08460 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Kcnma1Q08460 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Kcnma1Q08460 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Kcnma1Q08460 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Kcnma1Q08460 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Kcnma1Q08460 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Kcnma1Q08460 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Kcnma1Q08460 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Kcnma1Q08460 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Kcnma1Q08460 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Kcnma1Q08460 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Kcnma1Q08460 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Kcnma1Q08460 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Kcnma1Q08460 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Kcnma1Q08460 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Kcnma1Q08460 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Kcnma1Q08460 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Kcnma1Q08460 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Kcnma1Q08460 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Kcnma1Q08460 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Kcnma1Q08460 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Kcnma1Q08460 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Kcnma1Q08460 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms