Protein–RNA interactions for Protein: Q06348

Prrx2, Paired mesoderm homeobox protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrx2Q06348 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Prrx2Q06348 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Prrx2Q06348 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Prrx2Q06348 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Prrx2Q06348 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Prrx2Q06348 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Prrx2Q06348 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Prrx2Q06348 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Prrx2Q06348 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Prrx2Q06348 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Prrx2Q06348 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Prrx2Q06348 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Prrx2Q06348 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Prrx2Q06348 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Prrx2Q06348 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Prrx2Q06348 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Prrx2Q06348 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Prrx2Q06348 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Prrx2Q06348 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Prrx2Q06348 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Prrx2Q06348 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Prrx2Q06348 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Prrx2Q06348 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Prrx2Q06348 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Prrx2Q06348 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Prrx2Q06348 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Prrx2Q06348 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Prrx2Q06348 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Prrx2Q06348 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Prrx2Q06348 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Prrx2Q06348 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Prrx2Q06348 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Prrx2Q06348 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Prrx2Q06348 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Prrx2Q06348 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Prrx2Q06348 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Prrx2Q06348 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Prrx2Q06348 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Prrx2Q06348 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Prrx2Q06348 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Prrx2Q06348 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Prrx2Q06348 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Prrx2Q06348 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Prrx2Q06348 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Prrx2Q06348 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Prrx2Q06348 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Prrx2Q06348 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Prrx2Q06348 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Prrx2Q06348 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Prrx2Q06348 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Prrx2Q06348 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Prrx2Q06348 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Prrx2Q06348 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Prrx2Q06348 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Prrx2Q06348 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Prrx2Q06348 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Prrx2Q06348 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Prrx2Q06348 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Prrx2Q06348 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Prrx2Q06348 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Prrx2Q06348 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Prrx2Q06348 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Prrx2Q06348 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Prrx2Q06348 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Prrx2Q06348 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Prrx2Q06348 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Prrx2Q06348 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Prrx2Q06348 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Prrx2Q06348 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Prrx2Q06348 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Prrx2Q06348 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Prrx2Q06348 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Prrx2Q06348 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Prrx2Q06348 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Prrx2Q06348 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Prrx2Q06348 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Prrx2Q06348 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Prrx2Q06348 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Prrx2Q06348 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Prrx2Q06348 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Prrx2Q06348 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Prrx2Q06348 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Prrx2Q06348 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Prrx2Q06348 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Prrx2Q06348 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Prrx2Q06348 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Prrx2Q06348 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Prrx2Q06348 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Prrx2Q06348 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Prrx2Q06348 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Prrx2Q06348 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Prrx2Q06348 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Prrx2Q06348 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Prrx2Q06348 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Prrx2Q06348 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Prrx2Q06348 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Prrx2Q06348 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Prrx2Q06348 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Prrx2Q06348 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Prrx2Q06348 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms