Protein–RNA interactions for Protein: Q04888

Sox10, Transcription factor SOX-10, mousemouse

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox10Q04888 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sox10Q04888 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sox10Q04888 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sox10Q04888 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Sox10Q04888 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sox10Q04888 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sox10Q04888 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sox10Q04888 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sox10Q04888 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sox10Q04888 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sox10Q04888 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sox10Q04888 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sox10Q04888 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sox10Q04888 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sox10Q04888 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sox10Q04888 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sox10Q04888 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sox10Q04888 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sox10Q04888 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sox10Q04888 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sox10Q04888 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sox10Q04888 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sox10Q04888 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sox10Q04888 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sox10Q04888 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Sox10Q04888 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sox10Q04888 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sox10Q04888 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sox10Q04888 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sox10Q04888 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Sox10Q04888 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sox10Q04888 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sox10Q04888 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sox10Q04888 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sox10Q04888 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sox10Q04888 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sox10Q04888 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sox10Q04888 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sox10Q04888 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sox10Q04888 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Sox10Q04888 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Sox10Q04888 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Sox10Q04888 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Sox10Q04888 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sox10Q04888 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sox10Q04888 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sox10Q04888 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sox10Q04888 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sox10Q04888 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sox10Q04888 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sox10Q04888 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sox10Q04888 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sox10Q04888 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sox10Q04888 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Sox10Q04888 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sox10Q04888 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sox10Q04888 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sox10Q04888 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Sox10Q04888 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sox10Q04888 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sox10Q04888 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sox10Q04888 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sox10Q04888 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sox10Q04888 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sox10Q04888 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sox10Q04888 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sox10Q04888 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sox10Q04888 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sox10Q04888 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sox10Q04888 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sox10Q04888 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sox10Q04888 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Sox10Q04888 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sox10Q04888 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Sox10Q04888 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sox10Q04888 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Sox10Q04888 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Sox10Q04888 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sox10Q04888 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sox10Q04888 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sox10Q04888 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sox10Q04888 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sox10Q04888 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sox10Q04888 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sox10Q04888 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sox10Q04888 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sox10Q04888 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sox10Q04888 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sox10Q04888 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sox10Q04888 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sox10Q04888 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sox10Q04888 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sox10Q04888 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sox10Q04888 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sox10Q04888 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sox10Q04888 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sox10Q04888 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sox10Q04888 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sox10Q04888 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sox10Q04888 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms