Protein–RNA interactions for Protein: Q04447

Ckb, Creatine kinase B-type, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CkbQ04447 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CkbQ04447 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CkbQ04447 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CkbQ04447 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CkbQ04447 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CkbQ04447 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CkbQ04447 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CkbQ04447 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CkbQ04447 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CkbQ04447 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CkbQ04447 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CkbQ04447 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CkbQ04447 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CkbQ04447 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CkbQ04447 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CkbQ04447 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CkbQ04447 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CkbQ04447 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CkbQ04447 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CkbQ04447 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CkbQ04447 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CkbQ04447 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CkbQ04447 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CkbQ04447 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CkbQ04447 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CkbQ04447 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CkbQ04447 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CkbQ04447 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CkbQ04447 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CkbQ04447 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CkbQ04447 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CkbQ04447 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CkbQ04447 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CkbQ04447 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CkbQ04447 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CkbQ04447 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CkbQ04447 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CkbQ04447 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CkbQ04447 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CkbQ04447 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CkbQ04447 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CkbQ04447 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CkbQ04447 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CkbQ04447 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CkbQ04447 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CkbQ04447 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CkbQ04447 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CkbQ04447 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CkbQ04447 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CkbQ04447 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CkbQ04447 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CkbQ04447 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CkbQ04447 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CkbQ04447 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CkbQ04447 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CkbQ04447 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CkbQ04447 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CkbQ04447 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CkbQ04447 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CkbQ04447 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CkbQ04447 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CkbQ04447 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CkbQ04447 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CkbQ04447 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CkbQ04447 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CkbQ04447 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CkbQ04447 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CkbQ04447 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CkbQ04447 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CkbQ04447 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CkbQ04447 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CkbQ04447 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CkbQ04447 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CkbQ04447 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CkbQ04447 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CkbQ04447 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CkbQ04447 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CkbQ04447 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CkbQ04447 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CkbQ04447 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CkbQ04447 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CkbQ04447 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CkbQ04447 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CkbQ04447 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CkbQ04447 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CkbQ04447 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CkbQ04447 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CkbQ04447 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CkbQ04447 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CkbQ04447 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CkbQ04447 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CkbQ04447 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CkbQ04447 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CkbQ04447 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CkbQ04447 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CkbQ04447 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CkbQ04447 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CkbQ04447 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CkbQ04447 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CkbQ04447 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.5 ms