Protein–RNA interactions for Protein: Q03358

Msx2, Homeobox protein MSX-2, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx2Q03358 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Msx2Q03358 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Msx2Q03358 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Msx2Q03358 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Msx2Q03358 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Msx2Q03358 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Msx2Q03358 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Msx2Q03358 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Msx2Q03358 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Msx2Q03358 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Msx2Q03358 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Msx2Q03358 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Msx2Q03358 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Msx2Q03358 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Msx2Q03358 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Msx2Q03358 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Msx2Q03358 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Msx2Q03358 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Msx2Q03358 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Msx2Q03358 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Msx2Q03358 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Msx2Q03358 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Msx2Q03358 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Msx2Q03358 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Msx2Q03358 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Msx2Q03358 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Msx2Q03358 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Msx2Q03358 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Msx2Q03358 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Msx2Q03358 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Msx2Q03358 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Msx2Q03358 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Msx2Q03358 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Msx2Q03358 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Msx2Q03358 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Msx2Q03358 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Msx2Q03358 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Msx2Q03358 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Msx2Q03358 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Msx2Q03358 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Msx2Q03358 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Msx2Q03358 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Msx2Q03358 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Msx2Q03358 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Msx2Q03358 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Msx2Q03358 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Msx2Q03358 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Msx2Q03358 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Msx2Q03358 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Msx2Q03358 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Msx2Q03358 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Msx2Q03358 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Msx2Q03358 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Msx2Q03358 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Msx2Q03358 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Msx2Q03358 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Msx2Q03358 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Msx2Q03358 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Msx2Q03358 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Msx2Q03358 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Msx2Q03358 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Msx2Q03358 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Msx2Q03358 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Msx2Q03358 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Msx2Q03358 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Msx2Q03358 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Msx2Q03358 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Msx2Q03358 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Msx2Q03358 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Msx2Q03358 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Msx2Q03358 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Msx2Q03358 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Msx2Q03358 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Msx2Q03358 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Msx2Q03358 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Msx2Q03358 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Msx2Q03358 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Msx2Q03358 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Msx2Q03358 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Msx2Q03358 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Msx2Q03358 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Msx2Q03358 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Msx2Q03358 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Msx2Q03358 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Msx2Q03358 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Msx2Q03358 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Msx2Q03358 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Msx2Q03358 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Msx2Q03358 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Msx2Q03358 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Msx2Q03358 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Msx2Q03358 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Msx2Q03358 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Msx2Q03358 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Msx2Q03358 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Msx2Q03358 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Msx2Q03358 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Msx2Q03358 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Msx2Q03358 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Msx2Q03358 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms