Protein–RNA interactions for Protein: Q02067

Ascl1, Achaete-scute homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ascl1Q02067 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ascl1Q02067 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Ascl1Q02067 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ascl1Q02067 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ascl1Q02067 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ascl1Q02067 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Ascl1Q02067 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ascl1Q02067 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Ascl1Q02067 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Ascl1Q02067 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ascl1Q02067 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ascl1Q02067 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ascl1Q02067 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ascl1Q02067 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ascl1Q02067 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ascl1Q02067 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ascl1Q02067 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ascl1Q02067 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ascl1Q02067 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ascl1Q02067 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ascl1Q02067 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ascl1Q02067 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ascl1Q02067 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ascl1Q02067 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Ascl1Q02067 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ascl1Q02067 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ascl1Q02067 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ascl1Q02067 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ascl1Q02067 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ascl1Q02067 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ascl1Q02067 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ascl1Q02067 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ascl1Q02067 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ascl1Q02067 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ascl1Q02067 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ascl1Q02067 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ascl1Q02067 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ascl1Q02067 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ascl1Q02067 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ascl1Q02067 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ascl1Q02067 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ascl1Q02067 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ascl1Q02067 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ascl1Q02067 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Ascl1Q02067 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ascl1Q02067 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ascl1Q02067 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ascl1Q02067 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ascl1Q02067 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ascl1Q02067 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ascl1Q02067 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ascl1Q02067 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ascl1Q02067 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ascl1Q02067 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ascl1Q02067 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ascl1Q02067 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ascl1Q02067 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ascl1Q02067 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ascl1Q02067 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ascl1Q02067 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ascl1Q02067 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ascl1Q02067 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ascl1Q02067 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ascl1Q02067 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ascl1Q02067 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ascl1Q02067 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ascl1Q02067 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ascl1Q02067 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ascl1Q02067 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ascl1Q02067 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ascl1Q02067 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ascl1Q02067 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ascl1Q02067 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ascl1Q02067 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ascl1Q02067 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Ascl1Q02067 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ascl1Q02067 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ascl1Q02067 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ascl1Q02067 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ascl1Q02067 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ascl1Q02067 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ascl1Q02067 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ascl1Q02067 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ascl1Q02067 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ascl1Q02067 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Ascl1Q02067 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Ascl1Q02067 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Ascl1Q02067 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Ascl1Q02067 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Ascl1Q02067 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ascl1Q02067 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ascl1Q02067 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ascl1Q02067 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ascl1Q02067 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ascl1Q02067 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ascl1Q02067 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ascl1Q02067 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ascl1Q02067 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ascl1Q02067 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ascl1Q02067 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms