Protein–RNA interactions for Protein: Q01727

Mc1r, Melanocyte-stimulating hormone receptor, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mc1rQ01727 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mc1rQ01727 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mc1rQ01727 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mc1rQ01727 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mc1rQ01727 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mc1rQ01727 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Mc1rQ01727 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mc1rQ01727 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mc1rQ01727 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mc1rQ01727 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mc1rQ01727 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mc1rQ01727 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mc1rQ01727 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mc1rQ01727 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Mc1rQ01727 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mc1rQ01727 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mc1rQ01727 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mc1rQ01727 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mc1rQ01727 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mc1rQ01727 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mc1rQ01727 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mc1rQ01727 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mc1rQ01727 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mc1rQ01727 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mc1rQ01727 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mc1rQ01727 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mc1rQ01727 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mc1rQ01727 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mc1rQ01727 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mc1rQ01727 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mc1rQ01727 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Mc1rQ01727 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mc1rQ01727 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mc1rQ01727 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mc1rQ01727 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mc1rQ01727 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mc1rQ01727 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Mc1rQ01727 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mc1rQ01727 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mc1rQ01727 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mc1rQ01727 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mc1rQ01727 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mc1rQ01727 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mc1rQ01727 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Mc1rQ01727 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Mc1rQ01727 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mc1rQ01727 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Mc1rQ01727 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mc1rQ01727 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mc1rQ01727 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mc1rQ01727 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mc1rQ01727 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mc1rQ01727 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Mc1rQ01727 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mc1rQ01727 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mc1rQ01727 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mc1rQ01727 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mc1rQ01727 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mc1rQ01727 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mc1rQ01727 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mc1rQ01727 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mc1rQ01727 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mc1rQ01727 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mc1rQ01727 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mc1rQ01727 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mc1rQ01727 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mc1rQ01727 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mc1rQ01727 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mc1rQ01727 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mc1rQ01727 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mc1rQ01727 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mc1rQ01727 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mc1rQ01727 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Mc1rQ01727 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mc1rQ01727 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mc1rQ01727 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mc1rQ01727 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mc1rQ01727 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mc1rQ01727 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mc1rQ01727 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mc1rQ01727 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mc1rQ01727 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mc1rQ01727 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mc1rQ01727 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mc1rQ01727 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mc1rQ01727 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mc1rQ01727 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mc1rQ01727 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mc1rQ01727 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mc1rQ01727 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mc1rQ01727 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mc1rQ01727 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mc1rQ01727 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Mc1rQ01727 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mc1rQ01727 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mc1rQ01727 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mc1rQ01727 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mc1rQ01727 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mc1rQ01727 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mc1rQ01727 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms