Protein–RNA interactions for Protein: Q01149

Col1a2, Collagen alpha-2(I) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col1a2Q01149 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Col1a2Q01149 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Col1a2Q01149 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Col1a2Q01149 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Col1a2Q01149 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Col1a2Q01149 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Col1a2Q01149 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Col1a2Q01149 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Col1a2Q01149 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Col1a2Q01149 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Col1a2Q01149 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Col1a2Q01149 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Col1a2Q01149 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Col1a2Q01149 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Col1a2Q01149 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Col1a2Q01149 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Col1a2Q01149 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Col1a2Q01149 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Col1a2Q01149 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Col1a2Q01149 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Col1a2Q01149 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Col1a2Q01149 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Col1a2Q01149 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Col1a2Q01149 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Col1a2Q01149 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Col1a2Q01149 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Col1a2Q01149 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Col1a2Q01149 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Col1a2Q01149 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Col1a2Q01149 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Col1a2Q01149 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Col1a2Q01149 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Col1a2Q01149 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Col1a2Q01149 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Col1a2Q01149 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Col1a2Q01149 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Col1a2Q01149 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Col1a2Q01149 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Col1a2Q01149 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Col1a2Q01149 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Col1a2Q01149 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Col1a2Q01149 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Col1a2Q01149 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Col1a2Q01149 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Col1a2Q01149 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Col1a2Q01149 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Col1a2Q01149 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Col1a2Q01149 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Col1a2Q01149 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Col1a2Q01149 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Col1a2Q01149 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Col1a2Q01149 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Col1a2Q01149 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Col1a2Q01149 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Col1a2Q01149 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Col1a2Q01149 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Col1a2Q01149 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Col1a2Q01149 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Col1a2Q01149 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Col1a2Q01149 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Col1a2Q01149 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Col1a2Q01149 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Col1a2Q01149 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Col1a2Q01149 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Col1a2Q01149 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Col1a2Q01149 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Col1a2Q01149 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Col1a2Q01149 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Col1a2Q01149 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Col1a2Q01149 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Col1a2Q01149 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Col1a2Q01149 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Col1a2Q01149 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Col1a2Q01149 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Col1a2Q01149 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Col1a2Q01149 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Col1a2Q01149 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Col1a2Q01149 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Col1a2Q01149 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Col1a2Q01149 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Col1a2Q01149 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Col1a2Q01149 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Col1a2Q01149 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Col1a2Q01149 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Col1a2Q01149 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Col1a2Q01149 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Col1a2Q01149 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Col1a2Q01149 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Col1a2Q01149 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Col1a2Q01149 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Col1a2Q01149 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Col1a2Q01149 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Col1a2Q01149 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Col1a2Q01149 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Col1a2Q01149 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Col1a2Q01149 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Col1a2Q01149 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Col1a2Q01149 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Col1a2Q01149 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Col1a2Q01149 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms