Protein–RNA interactions for Protein: Q01065

Pde1b, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1B, mousemouse

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde1bQ01065 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pde1bQ01065 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pde1bQ01065 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pde1bQ01065 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pde1bQ01065 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pde1bQ01065 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pde1bQ01065 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pde1bQ01065 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pde1bQ01065 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pde1bQ01065 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pde1bQ01065 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pde1bQ01065 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pde1bQ01065 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pde1bQ01065 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pde1bQ01065 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pde1bQ01065 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pde1bQ01065 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pde1bQ01065 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pde1bQ01065 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pde1bQ01065 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pde1bQ01065 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pde1bQ01065 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Pde1bQ01065 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pde1bQ01065 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pde1bQ01065 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pde1bQ01065 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pde1bQ01065 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pde1bQ01065 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pde1bQ01065 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pde1bQ01065 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pde1bQ01065 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pde1bQ01065 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pde1bQ01065 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pde1bQ01065 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pde1bQ01065 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pde1bQ01065 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pde1bQ01065 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pde1bQ01065 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pde1bQ01065 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pde1bQ01065 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pde1bQ01065 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pde1bQ01065 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pde1bQ01065 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pde1bQ01065 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pde1bQ01065 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pde1bQ01065 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pde1bQ01065 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pde1bQ01065 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pde1bQ01065 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pde1bQ01065 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pde1bQ01065 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pde1bQ01065 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pde1bQ01065 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pde1bQ01065 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pde1bQ01065 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pde1bQ01065 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pde1bQ01065 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pde1bQ01065 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pde1bQ01065 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pde1bQ01065 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Pde1bQ01065 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pde1bQ01065 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pde1bQ01065 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pde1bQ01065 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pde1bQ01065 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pde1bQ01065 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pde1bQ01065 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pde1bQ01065 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pde1bQ01065 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pde1bQ01065 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pde1bQ01065 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pde1bQ01065 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pde1bQ01065 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Pde1bQ01065 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pde1bQ01065 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pde1bQ01065 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pde1bQ01065 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pde1bQ01065 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pde1bQ01065 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pde1bQ01065 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pde1bQ01065 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pde1bQ01065 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pde1bQ01065 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pde1bQ01065 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pde1bQ01065 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pde1bQ01065 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pde1bQ01065 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pde1bQ01065 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pde1bQ01065 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pde1bQ01065 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Pde1bQ01065 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Pde1bQ01065 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pde1bQ01065 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Pde1bQ01065 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pde1bQ01065 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pde1bQ01065 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pde1bQ01065 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pde1bQ01065 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pde1bQ01065 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pde1bQ01065 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms