Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT2

Prcd, Progressive rod-cone degeneration protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 53 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrcdQ00LT2 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
PrcdQ00LT2 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
PrcdQ00LT2 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
PrcdQ00LT2 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
PrcdQ00LT2 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
PrcdQ00LT2 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
PrcdQ00LT2 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
PrcdQ00LT2 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
PrcdQ00LT2 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
PrcdQ00LT2 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
PrcdQ00LT2 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
PrcdQ00LT2 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
PrcdQ00LT2 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
PrcdQ00LT2 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
PrcdQ00LT2 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
PrcdQ00LT2 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
PrcdQ00LT2 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
PrcdQ00LT2 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
PrcdQ00LT2 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
PrcdQ00LT2 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
PrcdQ00LT2 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
PrcdQ00LT2 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
PrcdQ00LT2 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
PrcdQ00LT2 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
PrcdQ00LT2 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
PrcdQ00LT2 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
PrcdQ00LT2 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
PrcdQ00LT2 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
PrcdQ00LT2 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
PrcdQ00LT2 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
PrcdQ00LT2 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
PrcdQ00LT2 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
PrcdQ00LT2 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
PrcdQ00LT2 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
PrcdQ00LT2 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
PrcdQ00LT2 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
PrcdQ00LT2 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
PrcdQ00LT2 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
PrcdQ00LT2 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
PrcdQ00LT2 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
PrcdQ00LT2 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
PrcdQ00LT2 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
PrcdQ00LT2 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
PrcdQ00LT2 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
PrcdQ00LT2 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
PrcdQ00LT2 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
PrcdQ00LT2 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
PrcdQ00LT2 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
PrcdQ00LT2 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
PrcdQ00LT2 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
PrcdQ00LT2 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
PrcdQ00LT2 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
PrcdQ00LT2 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
PrcdQ00LT2 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
PrcdQ00LT2 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
PrcdQ00LT2 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
PrcdQ00LT2 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
PrcdQ00LT2 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
PrcdQ00LT2 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
PrcdQ00LT2 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
PrcdQ00LT2 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
PrcdQ00LT2 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.76
PrcdQ00LT2 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
PrcdQ00LT2 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
PrcdQ00LT2 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
PrcdQ00LT2 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
PrcdQ00LT2 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC10.27□□□□□ -0.76
PrcdQ00LT2 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
PrcdQ00LT2 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
PrcdQ00LT2 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.76
PrcdQ00LT2 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
PrcdQ00LT2 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
PrcdQ00LT2 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
PrcdQ00LT2 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
PrcdQ00LT2 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
PrcdQ00LT2 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
PrcdQ00LT2 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
PrcdQ00LT2 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
PrcdQ00LT2 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
PrcdQ00LT2 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
PrcdQ00LT2 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
PrcdQ00LT2 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
PrcdQ00LT2 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
PrcdQ00LT2 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
PrcdQ00LT2 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
PrcdQ00LT2 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
PrcdQ00LT2 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
PrcdQ00LT2 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
PrcdQ00LT2 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
PrcdQ00LT2 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
PrcdQ00LT2 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
PrcdQ00LT2 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
PrcdQ00LT2 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
PrcdQ00LT2 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
PrcdQ00LT2 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
PrcdQ00LT2 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
PrcdQ00LT2 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
PrcdQ00LT2 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
PrcdQ00LT2 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
PrcdQ00LT2 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms