Protein–RNA interactions for Protein: Q00977

Gjb2, Gap junction beta-2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb2Q00977 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gjb2Q00977 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gjb2Q00977 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gjb2Q00977 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gjb2Q00977 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gjb2Q00977 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gjb2Q00977 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gjb2Q00977 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gjb2Q00977 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gjb2Q00977 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gjb2Q00977 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gjb2Q00977 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gjb2Q00977 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gjb2Q00977 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gjb2Q00977 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gjb2Q00977 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gjb2Q00977 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Gjb2Q00977 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gjb2Q00977 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gjb2Q00977 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gjb2Q00977 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gjb2Q00977 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gjb2Q00977 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gjb2Q00977 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gjb2Q00977 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gjb2Q00977 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gjb2Q00977 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gjb2Q00977 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gjb2Q00977 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gjb2Q00977 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gjb2Q00977 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gjb2Q00977 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gjb2Q00977 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gjb2Q00977 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gjb2Q00977 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Gjb2Q00977 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gjb2Q00977 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gjb2Q00977 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gjb2Q00977 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Gjb2Q00977 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gjb2Q00977 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gjb2Q00977 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gjb2Q00977 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gjb2Q00977 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gjb2Q00977 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gjb2Q00977 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gjb2Q00977 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Gjb2Q00977 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gjb2Q00977 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gjb2Q00977 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gjb2Q00977 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gjb2Q00977 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gjb2Q00977 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gjb2Q00977 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gjb2Q00977 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gjb2Q00977 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gjb2Q00977 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gjb2Q00977 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gjb2Q00977 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gjb2Q00977 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gjb2Q00977 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gjb2Q00977 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Gjb2Q00977 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gjb2Q00977 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gjb2Q00977 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gjb2Q00977 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gjb2Q00977 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Gjb2Q00977 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Gjb2Q00977 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gjb2Q00977 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gjb2Q00977 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gjb2Q00977 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gjb2Q00977 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gjb2Q00977 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gjb2Q00977 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gjb2Q00977 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gjb2Q00977 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gjb2Q00977 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gjb2Q00977 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gjb2Q00977 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gjb2Q00977 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gjb2Q00977 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gjb2Q00977 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gjb2Q00977 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gjb2Q00977 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gjb2Q00977 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gjb2Q00977 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gjb2Q00977 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gjb2Q00977 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gjb2Q00977 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gjb2Q00977 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gjb2Q00977 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gjb2Q00977 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gjb2Q00977 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gjb2Q00977 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gjb2Q00977 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gjb2Q00977 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gjb2Q00977 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gjb2Q00977 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Gjb2Q00977 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms