Protein–RNA interactions for Protein: P97350

Pkp1, Plakophilin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1P97350 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pkp1P97350 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pkp1P97350 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pkp1P97350 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pkp1P97350 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pkp1P97350 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pkp1P97350 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pkp1P97350 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pkp1P97350 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pkp1P97350 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pkp1P97350 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pkp1P97350 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pkp1P97350 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pkp1P97350 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pkp1P97350 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pkp1P97350 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pkp1P97350 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pkp1P97350 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pkp1P97350 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pkp1P97350 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pkp1P97350 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pkp1P97350 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pkp1P97350 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pkp1P97350 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pkp1P97350 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pkp1P97350 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pkp1P97350 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pkp1P97350 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pkp1P97350 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pkp1P97350 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Pkp1P97350 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pkp1P97350 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pkp1P97350 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pkp1P97350 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pkp1P97350 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pkp1P97350 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pkp1P97350 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pkp1P97350 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pkp1P97350 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pkp1P97350 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pkp1P97350 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pkp1P97350 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pkp1P97350 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pkp1P97350 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pkp1P97350 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pkp1P97350 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pkp1P97350 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pkp1P97350 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pkp1P97350 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pkp1P97350 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Pkp1P97350 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Pkp1P97350 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Pkp1P97350 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pkp1P97350 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Pkp1P97350 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pkp1P97350 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Pkp1P97350 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Pkp1P97350 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Pkp1P97350 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Pkp1P97350 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Pkp1P97350 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Pkp1P97350 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Pkp1P97350 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Pkp1P97350 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Pkp1P97350 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Pkp1P97350 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pkp1P97350 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pkp1P97350 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pkp1P97350 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pkp1P97350 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pkp1P97350 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pkp1P97350 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pkp1P97350 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Pkp1P97350 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pkp1P97350 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Pkp1P97350 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pkp1P97350 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Pkp1P97350 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pkp1P97350 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Pkp1P97350 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pkp1P97350 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Pkp1P97350 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pkp1P97350 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pkp1P97350 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pkp1P97350 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Pkp1P97350 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pkp1P97350 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pkp1P97350 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pkp1P97350 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pkp1P97350 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pkp1P97350 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pkp1P97350 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pkp1P97350 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pkp1P97350 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pkp1P97350 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pkp1P97350 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Pkp1P97350 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pkp1P97350 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pkp1P97350 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pkp1P97350 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms