Protein–RNA interactions for Protein: P82347

Sgcd, Delta-sarcoglycan, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgcdP82347 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SgcdP82347 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
SgcdP82347 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SgcdP82347 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SgcdP82347 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SgcdP82347 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SgcdP82347 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SgcdP82347 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SgcdP82347 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SgcdP82347 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SgcdP82347 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SgcdP82347 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SgcdP82347 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SgcdP82347 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SgcdP82347 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SgcdP82347 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SgcdP82347 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SgcdP82347 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
SgcdP82347 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SgcdP82347 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SgcdP82347 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
SgcdP82347 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SgcdP82347 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
SgcdP82347 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SgcdP82347 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
SgcdP82347 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SgcdP82347 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
SgcdP82347 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SgcdP82347 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SgcdP82347 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SgcdP82347 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
SgcdP82347 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
SgcdP82347 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SgcdP82347 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SgcdP82347 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
SgcdP82347 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SgcdP82347 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
SgcdP82347 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SgcdP82347 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SgcdP82347 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SgcdP82347 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SgcdP82347 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SgcdP82347 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SgcdP82347 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SgcdP82347 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SgcdP82347 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SgcdP82347 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SgcdP82347 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SgcdP82347 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SgcdP82347 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SgcdP82347 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SgcdP82347 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SgcdP82347 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SgcdP82347 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SgcdP82347 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SgcdP82347 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SgcdP82347 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SgcdP82347 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SgcdP82347 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SgcdP82347 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SgcdP82347 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
SgcdP82347 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SgcdP82347 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SgcdP82347 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SgcdP82347 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SgcdP82347 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SgcdP82347 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SgcdP82347 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
SgcdP82347 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SgcdP82347 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SgcdP82347 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SgcdP82347 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SgcdP82347 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SgcdP82347 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SgcdP82347 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SgcdP82347 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SgcdP82347 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SgcdP82347 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SgcdP82347 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
SgcdP82347 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SgcdP82347 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SgcdP82347 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SgcdP82347 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SgcdP82347 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SgcdP82347 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SgcdP82347 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SgcdP82347 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SgcdP82347 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SgcdP82347 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SgcdP82347 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SgcdP82347 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SgcdP82347 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SgcdP82347 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SgcdP82347 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SgcdP82347 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SgcdP82347 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SgcdP82347 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SgcdP82347 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SgcdP82347 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SgcdP82347 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
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