Protein–RNA interactions for Protein: P81068

Irx1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, mousemouse

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Length 480 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx1P81068 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Irx1P81068 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Irx1P81068 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Irx1P81068 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Irx1P81068 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Irx1P81068 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Irx1P81068 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Irx1P81068 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Irx1P81068 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Irx1P81068 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Irx1P81068 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Irx1P81068 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Irx1P81068 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Irx1P81068 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Irx1P81068 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Irx1P81068 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Irx1P81068 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Irx1P81068 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Irx1P81068 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Irx1P81068 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Irx1P81068 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Irx1P81068 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Irx1P81068 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Irx1P81068 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Irx1P81068 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Irx1P81068 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Irx1P81068 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Irx1P81068 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Irx1P81068 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Irx1P81068 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Irx1P81068 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Irx1P81068 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Irx1P81068 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Irx1P81068 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Irx1P81068 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Irx1P81068 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Irx1P81068 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Irx1P81068 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Irx1P81068 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Irx1P81068 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Irx1P81068 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Irx1P81068 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Irx1P81068 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Irx1P81068 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Irx1P81068 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Irx1P81068 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Irx1P81068 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Irx1P81068 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Irx1P81068 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Irx1P81068 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Irx1P81068 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Irx1P81068 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Irx1P81068 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Irx1P81068 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Irx1P81068 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Irx1P81068 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Irx1P81068 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Irx1P81068 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Irx1P81068 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Irx1P81068 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Irx1P81068 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Irx1P81068 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Irx1P81068 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Irx1P81068 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Irx1P81068 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Irx1P81068 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Irx1P81068 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Irx1P81068 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Irx1P81068 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Irx1P81068 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Irx1P81068 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Irx1P81068 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Irx1P81068 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Irx1P81068 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Irx1P81068 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Irx1P81068 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Irx1P81068 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Irx1P81068 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Irx1P81068 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Irx1P81068 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Irx1P81068 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Irx1P81068 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Irx1P81068 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Irx1P81068 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Irx1P81068 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Irx1P81068 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Irx1P81068 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Irx1P81068 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Irx1P81068 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Irx1P81068 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Irx1P81068 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Irx1P81068 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Irx1P81068 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Irx1P81068 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Irx1P81068 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Irx1P81068 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Irx1P81068 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Irx1P81068 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Irx1P81068 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Irx1P81068 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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