Protein–RNA interactions for Protein: P81067

Irx3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx3P81067 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Irx3P81067 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Irx3P81067 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Irx3P81067 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Irx3P81067 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Irx3P81067 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Irx3P81067 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Irx3P81067 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Irx3P81067 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Irx3P81067 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Irx3P81067 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Irx3P81067 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Irx3P81067 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Irx3P81067 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Irx3P81067 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Irx3P81067 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Irx3P81067 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Irx3P81067 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Irx3P81067 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Irx3P81067 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Irx3P81067 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Irx3P81067 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Irx3P81067 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Irx3P81067 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Irx3P81067 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Irx3P81067 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Irx3P81067 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Irx3P81067 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Irx3P81067 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Irx3P81067 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Irx3P81067 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Irx3P81067 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Irx3P81067 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Irx3P81067 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Irx3P81067 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Irx3P81067 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Irx3P81067 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Irx3P81067 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Irx3P81067 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Irx3P81067 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Irx3P81067 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Irx3P81067 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Irx3P81067 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Irx3P81067 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Irx3P81067 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Irx3P81067 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Irx3P81067 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Irx3P81067 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Irx3P81067 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Irx3P81067 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Irx3P81067 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Irx3P81067 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Irx3P81067 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Irx3P81067 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Irx3P81067 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Irx3P81067 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Irx3P81067 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Irx3P81067 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Irx3P81067 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Irx3P81067 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Irx3P81067 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Irx3P81067 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Irx3P81067 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Irx3P81067 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Irx3P81067 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Irx3P81067 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Irx3P81067 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Irx3P81067 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Irx3P81067 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Irx3P81067 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Irx3P81067 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Irx3P81067 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Irx3P81067 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Irx3P81067 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Irx3P81067 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Irx3P81067 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Irx3P81067 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Irx3P81067 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Irx3P81067 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Irx3P81067 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Irx3P81067 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Irx3P81067 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Irx3P81067 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Irx3P81067 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Irx3P81067 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Irx3P81067 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Irx3P81067 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Irx3P81067 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Irx3P81067 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Irx3P81067 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Irx3P81067 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Irx3P81067 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Irx3P81067 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Irx3P81067 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Irx3P81067 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Irx3P81067 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Irx3P81067 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Irx3P81067 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Irx3P81067 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Irx3P81067 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms